Velikost genoma se pri različnih organizmih razlikuje iz razlogov, ki sodobni znanosti niso povsem znani. Velikost genoma je v mnogih primerih ohlapno povezana s kompleksnostjo, vendar obstajajo številne pomembne izjeme. Na primer, nekatere bakterije in številne rastlinske vrste imajo večje genome kot ljudje. Izraz, ki se pogosto uporablja zamenljivo z velikostjo genoma, je “C-vrednost”. To je okrajšava za besedo “konstantno”, sklicevanje na dejstvo, da je velikost genoma med posamezniki iste vrste približno konstantna. Vprašanje, zakaj imajo nekateri preprosti organizmi velike genome, se v biologiji imenuje “enigma C-vrednosti”.
Odkritje “junk DNK” ali nekodirajoče DNK v zgodnjih sedemdesetih letih prejšnjega stoletja je delno rešilo enigmo o vrednosti C. Neželena DNK ne kodira za beljakovine, in čeprav obstajajo nedavni dokazi, da lahko uravnava, kako se geni vklopijo in izklopijo, ne prispeva niti približno toliko biološke kompleksnosti kot del DNK, ki vsebuje dejanske gene. Če upoštevate neželeno DNK, je število genov v organizmu v grobem korelirano s tem, kar bi intuitivno imenovali biološka kompleksnost.
Najpreprostejši odgovor na vprašanje razmerja med velikostjo genoma in vrsto organizma je, da ni povezave. Velikosti genoma se zelo razlikujejo tudi med isto kategorijo organizmov; na primer pri živalih je variacija za faktor 3,300, pri kopenskih rastlinah pa za faktor približno 1,000, pri protistih pa za kar 300,000.
Velikost genoma se meri na dva načina: po teži, v pikogramih in po baznih parih, v milijonih baz ali megabazah. Človeški genom vsebuje približno 3,000 megabaz, vendar le 1.5 % genoma dejansko kodira prave gene. Genom piščanca vsebuje približno 1,300 megabaz. Školjka ima približno 3,200, prav tako miši. Nekatere žabe imajo 6,500 megabaz, kar je več kot dvakrat večje od človeškega genoma. pikapolonica ima približno 300 megabaz. Nemogoče je uganiti velikost genoma organizma samo s pogledom, razen če že imate predhodno znanje o odgovoru.