Računalnik se lahko samodejno znova zažene zaradi težav s programsko opremo ali okvare strojne opreme. Eden od pogostih vzrokov za samodejni ponovni zagon je, ko je operacijski sistem (OS) naložil kritično posodobitev, ki jo je treba takoj uporabiti. Drugi samodejni ponovni zagoni so lahko posledica zrušitev programske opreme, v tem primeru se lahko prikaže zaslon, ki prikazuje, kaj ni uspelo. Računalnik se lahko samodejno znova zažene tudi zaradi okvar strojne opreme, kot je težava s centralno procesno enoto (CPU), grafično procesno enoto (GPU) ali napajalno enoto (PSU). Nedelujoči ventilatorji, slab stik hladilnega telesa ali presežek prahu lahko povzročijo dovolj toplote, da povzroči izklop.
Nekateri operacijski sistemi so zasnovani tako, da se samodejno znova zaženejo, ko se prenese kritična posodobitev ali popravek in je pripravljen za namestitev. Operacijski sistem lahko uporabniku da možnost, da odloži ponovni zagon, čeprav postopka običajno ni mogoče onemogočiti. Pogosto je mogoče popolnoma onemogočiti samodejni ponovni zagon, čeprav se postopek razlikuje od enega OS do drugega in celo med različicami. Včasih je to možnost v upravitelju posodobitev, v drugih primerih pa so potrebne naprednejše tehnike, kot je urejanje registra.
Drugi razlogi, povezani s programsko opremo, da se računalnik samodejno znova zažene, so običajno povezani z nekakšno okvaro. Zrušitev gonilnika lahko povzroči samodejni ponovni zagon, čeprav lahko tudi številne druge napake. Če se računalnik redno samodejno znova zažene, je morda neka vrsta virusa ali zlonamerne programske opreme. V tem primeru je lahko dobra ideja zagnati različne programe za odkrivanje prisotnosti zlonamerne programske opreme.
Napake strojne opreme lahko povzročijo tudi samodejni ponovni zagon računalnika. Če lahko računalnik na kakršen koli način spremlja temperaturo komponent, kot so pomnilnik z naključnim dostopom (RAM), CPU in GPU, je to eno mesto za začetek raziskovanja. Te temperature lahko opazujemo, da ugotovimo, ali je ena nenormalno visoka v času samodejnega ponovnega zagona, v tem primeru je ta komponenta verjetni krivec. Slab hladilno telo ali ventilator, ki ne deluje, lahko povzročita pregrevanje nekaterih od teh komponent, čeprav bo morda potrebna zamenjava same komponente.
Napajalna enota lahko povzroči tudi izklop računalnika, če ne zagotavlja dovolj električne energije različnim komponentam. Ta situacija se pogosto pojavi po namestitvi novih komponent, ker lahko napredne grafične kartice in druge nadgradnje porabijo veliko energije. Možno je tudi, da napajalna enota preneha pravilno delovati zaradi starosti ali okvare notranjih komponent. Prah lahko poleg različnih drugih delov računalnika povzroči tudi odvečno toploto v napajalnikih, kar lahko privede do samodejnih izklopov ali prezgodnje odpovedi komponent.