V grški mitologiji je Perzej eden od skupine junakov, ki vključuje tudi
Tezej, Ahil, Jazon, Odisej, Herkul in Belerofon. Njegova zgodba se začne pri njegovem dedku po materini strani, kralju Akriziju iz Arga. Orakelj je kralju povedal, da ga bo ubil sin njegove hčerke Danae, in ta se je odzval tako, da jo je zaklenil v stolp.
A Akrizij se ni računal z Zevsom, ki se je odločil, da hoče osvoboditi Danae, in se je nanjo spustil kot zlata ploha. Rezultat povezave je bil dojenček Perzej. Akrizij ni čutil, da bi lahko neposredno ubil svojo hčer, zato je Danae in otroka dal v leseno skrinjo in jo vrgel v morje. Rešil jih je ribič na otoku Serifhos in kralj Serifosa Polidekt ju je sprejel na dvoru in Perzej je tam odraščal.
Polidektova prvotna prijaznost se je spremenila v željo po Danai, ki se je ni zanimala za poroko. Ker je Perzej zaščitil svojo mater, se je Polidekt pretvarjal, da popusti in da išče nevesto drugje. Vse svoje podložnike je prosil, naj prispevajo k poročnemu darilu, in Perzej, ki ni imel nič materialne vrednosti, je ponudil kralju svoje storitve. Polidekt ga je prosil za glavo Meduze Gorgone, s polnim namenom, da bo naloga mladeničeva poguba, saj je Meduzin pogled ljudi obrnil v kamen.
In res bi Perzej morda poginil v boju z Meduzo, če ne bi bilo posredovanja Atene, ki je imela Meduzo za svojega sovražnika. Atena je junaka opozorila na nevarnost Meduzinega pogleda in mu dala tako sijoč ščit, da bi lahko služil kot ogledalo. Hermes mu je dal srp in usnjeno torbo ter ga napotil, kje naj najde Graje, sestre Gorgon, ki bi lahko – če bi želele – usmerile Perzeja, kje bi lahko našel Meduzo, pa tudi kapo nevidnosti in krilate sandale , oboje bi potreboval, če bi lahko premagal Gorgono.
Graiae so živeli blizu gore Atlas in so se odlikovali po tem, da so imeli eno oko, ki so si ga delili. Perzej se jim je prikradel in jim ugrabil oko, ko so ga peljali med seboj. Ker jim ga ni hotel vrniti, dokler niso odgovorili na njegova vprašanja in ker so bili brez očesa nemočni, je dobil, kar je hotel.
S temi pomočniki se je Perzej lahko nevidno približal Meduzi, jo ubil, ne da bi jo pogledal, ji odrezal glavo in jo dal v vrečo. Krilati konj Pegaz se je rodil iz Meduzinega brezglavega telesa.
Ko je letel domov s svojimi krilatimi sandali, je Perzej opazil princeso Andromedo, priklenjeno na skalo v oceanu, ki je bila krma za morsko pošast. Junak je s pogledom na Meduzino glavo spremenil morsko pošast v kamen in rešil princeso. Ko jo je vrnil staršem, kralju Cefeju in kraljici Kasiopeji, je zaprosil za Andromedino roko in po soglasju sta se skupaj vrnila v Serifos.
Ko je prispel v Serifos, je Perzej ugotovil, da se je Danaja zatekla k ribiču, ki ju je prvi rešil, da bi se izognila Polidektovemu nezaželenemu ukrepu. Meduzina glava je prišla prav za okamenitev Polidekta in ribič Diktis je postal kralj, Danaja, Perzej in Andromeda pa so se odpravili v Argos, potem ko je Perzej vrnil ščit Ateni in ji dal Meduzino glavo. Akrizij je odšel k Larisi, da bi se skušal izogniti svojemu vnuku in njegovi usodi, toda Perzej je prejel povabilo v Lariso, da se udeleži pogrebnih iger kraljevega očeta. Ko je sodeloval v pogrebnih igrah, je Perzej vrgel disk, ki je zašel in udaril starca na tribuni – Akrizija – in ga ubil. Konec zgodbe ima več različic, odvisno od avtorja.