John Edgar Hoover je najbolj kontroverzen direktor FBI v zgodovini ZDA. Čeprav je bil v času svojega življenja zelo spoštovan, so se po njegovi smrti leta 1972 razvnele polemike. Po nekaterih virih je J. Edgar Hoover zlorabil svojo avtoriteto, pri čemer je nekatere osebnosti preganjal zaradi njihovih političnih prepričanj in ne zaradi kriminalnih dejavnosti.
J. Edgar Hoover, rojen 1. januarja 1895, je diplomiral na univerzi George Washington z diplomo iz prava in skoraj takoj začel delati na ministrstvu za pravosodje. Njegova hitra pamet in visoka inteligenca sta jim prinesla vrsto napredovanj in do leta 1924 je bil imenovan za vodjo BOI (Bureau of Investigation), kasneje preimenovanega v FBI. Glavni direktor je ostal 49 let, kar je bila poteza, ki so jo močno kritizirali tako predsedniki kot organi pregona. Po njegovi smrti je FBI sprejel zakon, ki direktorje FBI omeji na desetletni mandat.
J. Edgar Hoover si je prislužil priznanje za prijetje članov nemških podmornic, ki so se med drugo svetovno vojno sprehajale po ameriški obali. Odgovoren je bil tudi za ustvarjanje boljše, večje različice datotečnega sistema prstnih odtisov, kar je pripeljalo do ustanovitve laboratorija FBI. J. Edgar Hoover je ustanovil FBI-jevo akademijo za usposabljanje in se osredotočil na novačenje več agentov za širitev agencije.
Po drugi strani si je J. Edgar Hoover pridobil sloves političnega preganjanja, zlasti proti tistim, za katere je menil, da so »krivi« sprejemanja komunizma ali motenja miru. To je vključevalo številne nepolitične osebnosti, kot so Martin Luther King, mlajši, Charles Chaplin in stranka Črnega panterja. J. Edgar Hoover je bil tudi zelo kritiziran, ker se ni poglobil v atentat na predsednika Johna F. Kennedyja. Medtem ko je FBI vodil preiskavo, je agencija zavrnila obravnavo ideje o zaroti, zaradi česar so drugi verjeli v vpletenost notranjih oseb v JFK-jevo smrt. J. Edgar Hoover je hranil tajne datoteke o številnih najvišjih političnih voditeljih svojega časa, za katere mnogi verjamejo, da je uporabljal za nadzor in ustrahovanje močnih osebnosti.
Skozi svojo kariero je bil J. Edgar Hoover zelo prizanesljiv do mafije. Strokovnjaki menijo, da je to zato, ker so različne mafijske organizacije imele preklete informacije o Hooverjevem skrivnem življenju kot homoseksualcu in križarju, s katerimi so ga izsiljevali, da bi se podredil. Ali je to res ali ne, je bila tema vročih razprav že desetletja in še danes ostaja nejasno.