Najpogostejši vzrok za zamudo menstruacije je nosečnost, vendar obstaja veliko možnih vzrokov. Metode kontracepcije, dojenje in čustveni stres so tudi nekateri možni vzroki za zamudo menstruacije. Nosečnost je najpogostejša, ko je ženska spolno aktivna in bi jo verjetno morali najprej izključiti, vendar zgodnja nosečnost morda ne bo zabeležena na osnovnih testih nosečnosti. Obisk zdravstvenega delavca je na splošno priporočljiv, ko ženska doživi nepojasnjen izpad menstruacijskega ciklusa.
Ko je menstruacija izostala in je bila ženska spolno aktivna, je nosečnost običajno prva in pogosto pravilna domneva. Sodobni testi nosečnosti so običajno izjemno natančni, če se pravilno upoštevajo navodila in lahko odkrijejo nosečnost že pet dni pred zamudo menstruacije. Vendar pa zgodnje odkrivanje morda ni tako natančno kot testi nosečnosti, opravljeni po zamudi menstruacije.
Metode kontracepcije lahko povzročijo zamudo menstruacije iz več razlogov. Zamenjava metod kontracepcije lahko včasih povzroči zamudo menstruacije, saj se telo prilagaja na novo obliko reguliranega cikla. Druge oblike kontracepcije ali metode za uporabo določene vrste kontracepcije lahko namenoma zatrejo menstruacije ali povzročijo, da se pojavljajo veliko bolj neredno kot brez regulacije.
Dojenje lahko prepreči vrnitev menstruacije, dokler ženska ne preneha dojiti. Nekatere ženske poročajo, da so imele redne menstruacije šele po odvajanju svojega otroka, vendar mnoge ženske začnejo menstruacijo v tednih ali mesecih po rojstvu otroka. To je normalno, vendar pomeni tudi, da lahko ženska ponovno zanosi. Če je bila pomanjkanje plodnosti zaradi dojenja uporabljena kot metoda kontracepcije, se bo morala ženska obrniti na druge metode za preprečevanje nosečnosti.
Številni vzroki za čustveni, duševni in fizični stres lahko povzročijo zamujeno menstruacijo. Ko je telo pod velikim stresom, se verjame, da lahko to moti normalno delovanje na način, ki lahko povzroči, da menstruacija ne pride. Količina stresa, ki je potrebna, da povzroči to izgubo običajnega delovanja, se lahko močno razlikuje od osebe do osebe, trajne ravni stresa pa lahko povzročijo pomanjkanje menstruacije za daljše časovno obdobje. Nekateri pogosti primeri vrst stresa, ki lahko povzročijo zamudo menstruacije, vključujejo zahtevno delovno obdobje, hudo čustveno obremenitev, ki jo povzroča težava v razmerju, ali smrt nekoga blizu.