Klopidogrel se pogosto daje za preprečevanje krvnih strdkov in tudi za preprečevanje možganske kapi. Žal so s tem zdravilom povezani različni stranski učinki, vendar je dobra novica, da jih doživi le malo bolnikov, najpogostejši pa se štejejo za manjše. Na primer, driska, simptomi gripe in glavobol so med najpogostejšimi stranskimi učinki klopidogrela in čeprav jih je treba obvestiti zdravnika, v večini primerov niso razlog za skrb. Po drugi strani je to zdravilo namenjeno zdravljenju težav, povezanih s krvjo, vendar lahko na koncu povzroči nekatere negativne učinke, kot sta krvav nos ali krvavo bruhanje. Nekatere neželene učinke tega zdravila lahko bolniki težko opazijo, vendar se lahko pojavijo ob naslednjem obisku pri zdravniku, na primer zmanjšana količina trombocitov in razvoj razjed na želodcu.
Nekateri neželeni učinki zdravila Clopidogrel so lahko moteči za bolnike, vendar niso nujno življenjsko nevarni ali zahtevajo takojšnjo zdravniško oskrbo. Pojavijo se lahko na primer driska, slabost in glavobol, vendar jih je običajno mogoče zdraviti s počitkom ali zdravili. Nekateri ljudje opazijo tudi simptome gripe, kot so mrzlica in bolečine v telesu, skupaj z omotico in kožnim izpuščajem. Te neželene učinke klopidogrela je treba verjetno omeniti ob naslednjem obisku pri zdravniku, vendar ne smejo preprečiti bolniku, da nadaljuje z jemanjem zdravila kot običajno.
Čeprav je to zdravilo namenjeno reševanju težav, povezanih s krvjo, kot so strdki, ima lahko tudi povezane neželene učinke. Nekateri bolniki na primer opazijo krvavitev, ki traja dlje, kot bi morala, da se ustavi, kar je še posebej opazno, ko imajo krvav nos. Nekateri ljudje začnejo tudi bruhati kri ali jo opazijo v blatu ali urinu. Končno se lahko na telesu pojavijo nenadne modrice, kar kaže, da to zdravilo negativno vpliva na kri. Večino bolnikov s katerim koli od teh neželenih učinkov klopidogrela običajno priporočamo, da pokličejo svojega zdravnika, da ugotovijo, ali naj nadaljujejo z jemanjem zdravila.
Nekateri stranski učinki klopidogrela niso očitni povprečnemu bolniku do obiska pri zdravniku. Na primer, lahko se zmanjša količina trombocitov v krvi, zmanjša pa se lahko tudi število celic v imunskem sistemu. Nekateri bolniki imajo lahko tudi razjedo na želodcu, čeprav vsi ne poznajo simptomov tega stanja in se zato morda ne zavedajo njegove prisotnosti. Po drugi strani pa nekaterim bolnikom nekatere neželene učinke klopidogrela težko prezrejo, kot je utrujenost, ki jo povzroča anemija, čeprav seveda morda ne bodo vedeli vzroka za težavo do obiska pri zdravniku.