Določanje najbolj priljubljenih znanstvenofantastičnih filmov je predmet razprave. Analitiki si lahko ogledajo »številke« in vidijo, kateri znanstvenofantastični filmi so prinesli največ denarja. Na žalost legije oboževalcev ne štejejo vseh znanstvenofantastičnih filmov, ki služijo denar, za “najboljše”. Na primer, Star Wars: The Phantom Menace in Star Wars: The Revenge of the Sith, sta obe zaslužili več denarja kot originalni Star Wars. Če pogledate sezname »najboljših znanstvenofantastičnih filmov«, se izvirna Vojna zvezd vedno uvršča med veliko boljši film, številni kritiki pa so omajali drugo trilogijo filmov Vojne zvezd.
Drug primer bi bil drugi film Matrix, ki je imel višjo uspešnost na blagajni kot originalni film Matrix. Spet se prvi film pogosto šteje za veliko boljši od njegovih nadaljevanj. Poleg tega so znanstvenofantastični filmi, ki so bili posneti pred sedemdesetimi leti prejšnjega stoletja, prinesli manj denarja, vendar mnogi kritiki in oboževalci menijo, da so nujni ogled.
Tako je vprašanje določanja najbolj priljubljenih znanstvenofantastičnih filmov zelo subjektivno. Kar si lahko ogledate, je pogostost, s katero se filmi pojavljajo na seznamih kritikov, v upanju, da bodo našli nekaj »najboljših« za ogled ali pregled. Ta in seveda osebni okus lahko posamezniku pomaga pri določanju najbolj priljubljenih znanstvenofantastičnih filmov.
V nobenem posebnem vrstnem redu se ti znanstvenofantastični filmi pojavljajo na številnih seznamih »najboljših«:
Vojna zvezd
Imperija vrne nazaj
2001: A Space Odyssey
Alien
Tujci
The Matrix
Vojna svetov (različica 1950-ih)
Metropolis
Terminator 2
ET
Gattaca
Bližnja srečanja s tretjega Kind
Nekateri ljudje v žanr znanstvene fantastike vključijo tudi grozljivke ali filme o pošastih. Priljubljeni filmi, ki se v tej kategoriji še vedno štejejo za »znanstveno fantastiko«, bi vključevali Stvar v režiji Johna Carpenterja, Jurski park, Frankenstein iz leta 1931 in Invazijo ugrabiteljev telesa iz leta 1956. Drugi menijo, da si filmi o pošastih in grozljivke z elementi znanstvenofantastičnih filmov zaslužijo svoj žanr.
Kritična manjšina bi rada vključila tudi znanstvenofantastične televizijske serije na svoje sezname najbolj priljubljenih. Jasno je, da prva in druga serija Star Trek, X-files, nedavni 4400 in Smallville predstavljajo nekaj izjemnega znanstvenofantastičnega dela. Drugi hvalijo Babilon 5 in serijo Jericho, da ne omenjam Lost kot odlično znanstveno fantastiko. Niso pa filmi, zato se ne uvrščajo na seznam najbolj priljubljenih znanstvenofantastičnih filmov. Za ljubitelje znanstvene fantastike so mnoge od teh serij prav tako zabavne kot popularni znanstvenofantastični filmi.