Vazektomija vključuje rezanje cevi, imenovane semenovod, ki prenaša spermo od mod do penisa. Je oblika moške sterilizacije, ki se izvaja v lokalni ali splošni anesteziji. Najpogostejši zapleti pri vazektomiji, tiste težave, ki se občasno lahko pojavijo kot posledica posega, niso tako pogoste, saj približno 90 odstotkov moških ne bo občutilo nobenih škodljivih učinkov. Ko se pojavijo zapleti pri vazektomiji, običajno vključujejo: okužbo, bolečino, krvavitev v mošnjo, občutek nenavadnega polnega moda in iztekanje sperme, ki tvori kepo, znano kot granulom. V redkih primerih postopek vazektomije ne uspe, ker se odrezani konci semenovoda uspejo ponovno zrasti.
Zapleti pri vazektomiji, kot je okužba, se lahko pojavijo zaradi vstopa bakterij v telo skozi reze v mošnjici kot del operacije. Znaki okužbe lahko vključujejo bolečino, vročino, pordelost in oteklino. Ohranjanje čistega genitalnega področja po vazektomiji bo pomagalo preprečiti ta zaplet. Antibiotiki so zdravljenje izbire, če pride do okužbe.
Drug zaplet vazektomije, ki ga lahko občasno opazimo, je krvavitev. To se lahko zgodi v majhnem obsegu in povzroči modrice, ki izginejo same v nekaj tednih. Večja krvavitev lahko kaže na težavo in jo mora obiskati zdravnik. Včasih se kri nabira in tvori velik strdek, znan kot hematom, zaradi česar je mošnja videti otekla in boleča. To bo moral videti zdravnik in morda bo potrebna nadaljnja operacija, da se strdek odstrani.
Bolečina je eden tistih zapletov vazektomije, ki se lahko včasih nadaljuje po operaciji in postane dolgotrajen. To se zgodi le redkim moškim, bolečina pa se lahko razlikuje po pogostosti in naravi, od ostre zbadajoče bolečine do tope bolečine. Preprosti ukrepi, kot sta nošenje podpornega spodnjega perila in jemanje protivnetnih zdravil, lahko pomagajo, če pa nekirurške možnosti ne delujejo, je možno, da bo morda potrebna druga operacija, saj lahko brazgotinsko tkivo ujame živec ali drugo pomembno strukturo.
Granulom sperme je čvrsta kepa, ki nastane iz iztekle sperme in lahko občasno povzroči bolečino in vidno oteklino, ki se lahko zdravi s protivnetnimi zdravili. Občasno bo morda treba kirurško odstraniti pretirano velik in boleč granulom. Sperme so odgovorne tudi za občutek polnosti v modih, ki se lahko pojavi po vazektomiji, saj se kopičijo v prostorih za shranjevanje v strukturi, imenovani epididimis. Ta občutek običajno izgine sam od sebe v nekaj tednih, saj telo naravno absorbira spermo.
Redko pride do procesa, imenovanega rekanalizacija, kjer se odrezani konci semenovoda ponovno združijo. To se običajno zgodi v mesecih po vazektomiji in sčasoma postane manj verjetno. Vazektomije se lahko namerno obrnejo, vendar je operacija težka in lahko v mnogih primerih še vedno povzroči neplodnost, zato je postopek vazektomije najbolje obravnavati kot trajno metodo moške kontracepcije.