Najpogostejši neželeni učinki ustne vode so draženje ustne sluznice in pekoč občutek v ustih. Okus ustne vode lahko ostane več ur, zaradi česar ima hrana kovinski, grenak ali začinjen okus. Za lajšanje pekočega stranskega učinka v ustih lahko uporabite bolj subtilne okuse ustne vodice. Včasih lahko zaužitje velikih količin ustne vode povzroči hujše neželene učinke. Ti vključujejo slabost in bruhanje, omotico, drisko in omotico.
Čeprav nenamerno zaužitje majhnih količin ustne vode na splošno ne velja za resno, lahko namerno pitje ustne vode povzroči resne neželene učinke in se lahko izkaže celo za življenjsko nevarno. Neželeni učinki ustne vode lahko vključujejo izgubo zavesti, epileptične napade in celo srčni zastoj zaradi visoke vsebnosti alkohola v nekaterih ustni vodi. Ti neželeni učinki so podobni tistim, ki se pojavijo pri pitju prevelikih količin alkoholnih pijač.
Eden najbolj zaskrbljujočih stranskih učinkov ustne vode je njen potencial za povečanje tveganja za raka žrela in ustne votline. To je spet posledica visoke vsebnosti alkohola v nekaterih ustni vodi. Čeprav je za vzpostavitev dokončne povezave morda potrebnih več dokazov, je morda pametno uporabiti brezalkoholno ustno vodico. Drugi stranski učinki ustne vodice vključujejo draženje in luščenje ustnih tkiv, kar je neprijetno in lahko pripravi pogoje za okužbo ustne votline ali celo bolezen dlesni.
Prednosti ustne vode vključujejo njeno sposobnost zmanjšanja ustne bakterije, ki lahko povzročijo bolezni dlesni in okužbe zob. Ustna voda lahko pomaga tudi pri odstranjevanju zobnih oblog in slabega zadaha. Ljudje, ki uporabljajo ustno vodico ali vodice za izpiranje, ki vsebujejo fluor, so lahko manj izpostavljeni tveganju za nastanek kariesa. Nekatere ustne vodice lahko tudi pomirijo vneto grlo. Grgranje z ustno vodico lahko pomaga lajšati vneto grlo, ki ga povzroča okužba, vendar lahko prepogosto grgranje z ustno vodico na osnovi alkohola prispeva k bolečini.
Ko se pojavijo neželeni učinki ustne vode, se je treba posvetovati z zobozdravnikom. Lahko oceni poškodbe ustnega tkiva in razpravlja o ustni higieni z uporabo brezalkoholnih ustnih vodic. Nekateri zobozdravniki pa sploh ne priporočajo uporabe ustne vode, namesto tega priporočajo dober program ustne higiene, ki vključuje ščetkanje zob vsaj dvakrat na dan in nitkanje med obroki.