Osnovni stranski učinki lanu vključujejo napenjanje in želodčne motnje. Pri testiranju na živalih lahko laneno seme povzroči različne druge neželene učinke, čeprav teh učinkov pri ljudeh še nismo opazili. Pri uživanju katere koli vrste lanu, vključno z lanenim semenom, oljem in zdrobom, je najbolje, da te snovi zaužijemo zmerno.
Zaužitje velike količine nekuhanega lanenega semena, desetih žlic (148 ml) ali več, lahko povzroči zastrupitev. Ker lan vsebuje cinogene glikozide, je lahko uživanje več od priporočene količine lanu strupeno. Nekateri strokovnjaki za prehrano tudi menijo, da lahko uživanje velike količine lanu v kakršni koli obliki povzroči hormonsko neravnovesje.
Študije na živalih so pokazale, da lahko velika količina lanu vpliva na hormone. Te študije so povzročile nekaj zaskrbljenosti, čeprav znanstveniki ne verjamejo, da žito vpliva na ljudi na enak način kot na živali. Doslej ni bila dokazana kakršna koli povezava med lanom in prirojenimi napakami.
Poleg želodčnih motenj se skoraj vsi neželeni učinki lanu pojavijo, če ga zaužijemo v velikih količinah. Redno uživanje lanu lahko povzroči drisko in ohlapno blato. Medtem ko večina strokovnjakov za prehrano govori o prednostih lanu, je pametno, da se pred začetkom kakršnega koli dietnega režima, ki vključuje kakršen koli lan, pogovorite z zdravnikom.
Pomembno je tudi uživanje svežega lana. Lanena moka lahko postane žarka, če jo dlje časa pustite na polici trgovine. Tako veliko ljudi kupi cela lanena semena, nato pa jih zmeljejo, da bi ustvarili laneno moko. Če je bil zaužit žarek obrok, lahko neželeni učinki vključujejo bruhanje in slabost. Ker so učinki lanu na nosečnice večinoma neznani, mnogi zdravstveni strokovnjaki priporočajo, da se nosečnice izogibajo lanu ali ga uživajo previdno.
Večina zdravstvenih strokovnjakov se strinja, da ima lan številne prehranske prednosti, vključno z veliko količino prehranskih vlaknin, ki jih ne smemo prezreti. Kakršni koli stranski učinki lanu, ki jih čuti povprečna oseba, so običajno minimalni. Ko prvič zaužije lan, se lahko človek počuti rahlo napihnjenega in plinastega, čeprav je to normalna reakcija na lan.
Lan lahko dodajamo številnim različnim živilom ali ga zaužijemo celega. Poleg tega se laneno seme pogosto daje živini kot oblika krme. Če se pojavijo nenavadni neželeni učinki lanu, je najbolje, da prenehate jemati zdravilo in se takoj posvetujte z zdravnikom.