Za vzdrževanje zasebnega vodnjaka je veliko elementov. Običajno strokovnjaki svetujejo lastnikom vrtin, naj se naučijo spremljati svoje vrtine in se naučijo, kaj lahko povzroči težave. Na primer, malo lastnikov vodnjakov ve, da če vodnjak miruje več kot en teden, to negativno vpliva na vrtino. Tudi poškodbe žuželk, sifoniranje hrbta in druge težave lahko poškodujejo vodnjak. Lastnik se lahko izogne dragim računom za popravila tako, da profesionalec redno izvaja vzdrževalne preglede.
Hidrogeologi, ki preučujejo znanost o podtalnici, lastnikom svetujejo, da lahko zaradi neaktivnosti vodnjaka voda ne teče v vodnjak. Strokovnjaki za črpalke svetujejo, da lahko puščanje črpalke v prostem teku povzroči poslabšanje tesnil. Včasih črpalka v prostem teku izgubi svojo prednost, zaradi česar lastniki vrtin kupijo novo črpalko. Ko strokovnjak za črpalko servisira črpalko, mu mora lastnik obvestiti, če je bila vrtina neaktivna.
Eden najboljših načinov, kako se lastnik vrtine lahko izogne težavam, je, da se nauči spremljati delovanje vrtine. Oseba naj pokliče strokovnjaka, ko opazi spremembe v okusu, barvi ali vonju vode ali ko so v vodi majhni delci. Kontaminirana voda lahko povzroči nenaden priliv gastrointestinalnih bolezni. Te težave običajno kažejo na dobro ali težave s cevmi.
Razpokani ali zlomljeni pokrovi ali pokrovi vodnjakov so pogosto vir onesnaženja vrtin, zato bi jih moral lastnik pregledati med pregledi vzdrževanja vrtine. Na nekaterih območjih, kjer sta pokrov in pokrov vodnjaka izpostavljen ekstremnim dejavnikom, strokovnjaki svetujejo, da lastniki ju preverijo po močnem dežju, močnem sneženju in drugih potencialno nevarnih dogodkih. Kjer električni kabli vstopijo v pokrov vodnjaka, se lahko tesnilna masa skrči, kar omogoči vstop kontaminantom v vodnjak.
Eden najpomembnejših elementov je črpalka za vrtino in nekatere stvari, ki jih lastnik vodnjaka spremlja, so hrup črpalke, tlak vode in vibracije. Slabo mazanje, ležaji in vibracije lahko povzročijo hrupno črpalko. Vibracije so lahko posledica nestabilne podlage ali neravnovesja znotraj motorja. Te težave lahko odpravi strokovnjak. Pomemben del vzdrževanja vrtine je, da lastnik upošteva vse predloge, ki jih lahko ponudi serviser, da prepreči ponovitev prejšnjih težav.
Vsako leto mora lastnik v okviru dobrega vzdrževanja vodnjaka testirati vodo. Včasih onesnaževalci vstopijo skozi pokvarjene ali puščajoče kapice ali pokrove vdolbinic, zato jih je pomembno pogosto preverjati. Da preprečite kontaminacijo vodnjaka skozi pokrov vodnjaka, sme pokrovček vodnjaka odstraniti in popraviti samo strokovnjak. Drugi kontaminati so lahko biološki – koliformne bakterije, E. coli in nitriti. Večina testov vključuje rezultate za druge nevarne materiale, kot sta arzen in radon.
Nekatere od različnih težav, na katere bi morali lastniki vrtin paziti med spremljanjem vzdrževanja vrtin, so znaki zamašitve zaslona in poškodbe žuželk. Na koncu cevi za dovod vode je zaslon za filtriranje delcev. Če umazanija zamaši zaslon, se lahko tlak vode zmanjša. Žuželke včasih vstopijo v tlačno stikalo črpalke in motijo njeno delovanje. Da bi preprečili električni udar ali poškodbe, mora oseba izklopiti črpalko, preden očisti stikalo.
Opazovanje človeških napak, mehanskih težav in drugih težav je del dobrega programa vzdrževanja vrtine. Nekateri ljudje dobro načrtujejo in preglede črpalk za določen dan na koledarju ali določen čas v letu. V resnici nadzor vodnjaka ni enkratna naloga. Dober lastnik vrtine nenehno spremlja svoj vodnjak in črpalko, opazuje in posluša spremembe v kakovosti vode in učinkovitosti črpalke. Z vzdrževanjem vodnjaka bosta vodnjak in črpalka na splošno trajala dlje, kakovost vode je običajno boljša in manj je sprememb za materialno škodo zaradi puščanja črpalke.