Varnost spletne vsebine je velik problem tako za velika spletna mesta z zapletenimi vsebinskimi sistemi in bazami podatkov kot za majhna spletna mesta s preprostim vmesnikom Hypertext Markup Language (HTML). Ena od prvih velikih stvari, ki jih mora lastnik spletnega mesta razumeti, je, da čeprav je spletno mesto majhno in ne vsebuje nobenih dragocenih informacij, ga lahko še vedno ciljajo hekerji. Lastnik spletnega mesta bi moral tudi preveriti spletno mesto za napake pri vnosu, kot so tiste, ki uporabnikom omogočajo pisanje HTML ali drugega kodiranja v vnosna področja. Druga področja, ki jih je treba preveriti, da zagotovite varnost spletne vsebine, so nastavitve uporabniških dovoljenj in preverjanje veljavnosti podatkov. Prav tako bi morali razumeti prevare z lažnim predstavljanjem in se vzdržati dajanja občutljivih informacij v kodiranje.
Mnogi lastniki spletnih mest, tako velikih kot majhnih, običajno verjamejo, da imajo spletno mesto, ki ne bo vdrto ali pa ni vredno vdreti. To verjetno velja za večino lastnikov spletnih mest, zlasti za tiste, ki so lastniki majhnih spletnih mest in samo objavljajo informacije o vsakdanjem življenju. Večina hekerjev napada velika spletna mesta, ker imajo dragocene informacije, drugi pa napadajo majhna spletna mesta samo za zabavo. Ne glede na velikost spletnega mesta je lahko vdrto, zato mora biti lastnik vedno v mislih varnosti.
Številna spletna mesta imajo območje, kjer lahko gostje vnesejo podatke, na primer razdelek za komentarje. Če spletno mesto nima meja glede vrednosti, ki jih je mogoče vnesti, ali dovoljuje, da se programski jeziki izvajajo iz teh vhodov, se virus zlahka vstavi v vhod. Na primer, če razdelek za komentarje uporabnikom omogoča izvajanje JavaScript®, lahko heker vnese skript za krajo informacij o piškotkih spletnega mesta. Za zaščito varnosti spletne vsebine mora skrbnik nastaviti vhode, da se programski jeziki ne aktivirajo.
Na spletnem mestu, na katerem deluje veliko uporabnikov hkrati, morajo biti vsa uporabniška dovoljenja postavljena na minimum. Če mora uporabnik samo prebrati nekaj informacij iz baze podatkov, mora skrbnik dovoliti samo to privilegij in nič drugega. Programi za preverjanje pristnosti in validacije pomagajo pri varnosti, preverjajo vse vhodne in odhodne informacije. Čeprav večina delavcev ne bo ukradla informacij, so najbližje delu s spletnim mestom in lahko zlahka ogrozijo varnost spletnih vsebin.
Z lažnim predstavljanjem lahko vstopite na spletno mesto in prepišete ali izbrišete vso spletno vsebino. Pri lažnem predstavljanju bo heker poslal e-pošto in se predstavljal kot podjetje, kot je podjetje za gostovanje domen. V e-poštnem sporočilu bo navedeno, da gostitelj potrebuje občutljive podatke, kot je skrbniško geslo spletnega skrbnika. Skrbniki nikoli ne smejo posredovati občutljivih informacij v e-pošti, ker bo to skoraj zagotovo povzročilo težave z varnostjo spletne vsebine.
V mnogih programskih jezikih obstaja oznaka, ki programerju omogoča, da napiše opombo. Te opombe so običajno nekaj majhnega, na primer s podrobnostmi o tem, kaj funkcija počne, vendar so druge opombe nevarne. Nekateri novi programerji lahko pustijo geslo v kodi, ki ga lahko prebere vsak. Skrbniki in programerji bi morali preveriti kakršne koli občutljive informacije, kot je ta, in jih nemudoma izbrisati iz kode.