Odprtokodne spletne konference uporabnikom omogočajo sodelovanje na sestankih, seminarjih in drugih dejavnostih v slogu konferenc prek interneta, vendar obstaja nekaj nasvetov o bontonu, ki bi jih morali uporabniki upoštevati. Uporabniki naj se oglasijo prvikrat, ko sodelujejo v razpravi, dokler se vsi udeleženci ne seznanijo drug z drugim. Če mora uporabnik govoriti z nekom, ki ni povezan s spletno konferenco, mora biti mikrofon izklopljen. Z odprtokodnim programom za spletne konference mora skrbnik prepoznati programsko kodo in biti seznanjen s skupnostjo uporabnikov. Ko uporabnik govori in uporablja spletno kamero, naj gleda v kamero in ne v zaslon računalnika.
Pri odprtokodnih spletnih konferencah ni nenavadno, da se zberejo udeleženci, ki se med seboj ne poznajo. To pomeni, da lahko nekatere uporabnike zmede, ko nekdo začne govoriti, ker morda ne vedo, kdo je govornik. Ustrezen bonton narekuje, da se mora vsak uporabnik oglasiti ob prvih nekaj besedah, tako da vsi vedo, kdo govori. Če je konferenca namenjena poslovnemu srečanju, naj uporabniki tudi izrazijo svoje stališče.
Ni nenavadno, da nekdo zazvoni telefon ali nekdo, ki ni povezan s konferenco, poskuša govoriti z uporabnikom med odprtokodno spletno konferenco. To lahko privede do nerodnih in motečih pogovorov, ki morda nimajo nobene zveze s konferenco. Za čim manj motenj mora uporabnik v teh primerih utišati svoj mikrofon – ali pa se takim primerom izogniti tako, da izklopi zvonjenje in ljudem v pisarni sporoči, da bo nekaj časa nedosegljiv.
Skrbniki in v manjši meri redni uporabniki bi morali poznati izvorno kodo odprtokodnega programa za spletne konference in njegov programski jezik. Izvorno kodo je mogoče pregledati in spremeniti v odprtokodnem programu, ki uporabnikom in skrbnikom omogoča optimizacijo programa za spletne konference za hitrost ali moč in bo pomagal odpraviti okvare. Poznavanje skupnosti uporabnikov spletnih konferenc lahko pomaga odpraviti morebitne težave.
Mnogi uporabniki imajo navado gledati v zaslon svojega računalnika, ko sodelujejo na spletni konferenci, še posebej, če uporabljajo spletno kamero. Če uporabniki to počnejo, ko govorijo, se zdi, kot da gledajo v drugo smer in niso pozorni. Uporabniki bodo morda želeli pogledati neposredno v spletno kamero, ker bo tako videti, kot da gledajo neposredno v druge uporabnike.