Glavna skrb pri konzerviranju pekoče paprike je sterilizacija pokrovov in kozarcev, v katerih se hranijo paprike. Domače konzervirane hrane, ki so nepravilno obdelane, tvegajo razvoj smrtonosne bakterije botulizma. Lahko bi domnevali, da je pekoča paprika zaradi pikantne narave zelenjave varna pred vdorom bakterij, vendar je ravno nasprotno. Pekoča paprika ima naravno nizko vsebnost kislin, zato je treba živila z nizko kislostjo vedno izpostaviti pritisku in toploti, da se zagotovi varno shranjevanje.
Prvi korak pri konzerviranju pekoče paprike vključuje zaščito rok in oči. Številne paprike, zlasti najbolj pekoče sorte, kot sta habaneros in paprika Bhut Jolokia iz severovzhodne Indije, lahko povzročijo hude opekline na goli koži. Pri ravnanju s papriko je najbolje nositi gumijaste rokavice ali rokavice iz lateksa, še posebej pa je ključnega pomena, da se ne dotikamo obraza ali oči. Snov, znana kot kapsaicin, povzroča toploto, ki je značilna za večino paprik. Neposredna izpostavljenost papriki z najvišjimi koncentracijami kapsaicina običajno povzroči hude bolečine, mehurje in morda celo slepoto.
Pekoče paprike je treba pripraviti pred konzerviranjem. Najpogostejši način priprave majhnih paprik se začne z luščenjem zunanje lupine. Paprike razrežite po dolžini, nato jih pecite v pečici pri 400 stopinjah Fahrenheita (204 stopinje Celzija), dokler se koža ne poruši. Pustite, da se paprike ohladijo, potopite v ledeno vodo, nato olupite lupino. Velike paprike je treba najprej razrezati na četrtine.
Kozarce za konzerviranje pekoče paprike je treba pred polnjenjem sterilizirati. Obrišite vrhove kozarcev, pokrove in trakove za zategovanje pokrovov. Zaprte kozarce je treba postaviti na stojalo za kozarce v tlačno posodo, ki vsebuje 2 palca (5.08 cm) vode. Zaprite pokrov tlačne pločevinke, povečajte toploto na visoko in sterilizirajte kozarce po navodilih proizvajalca. Na internetu so na voljo tudi tabele, ki določajo točne čase sterilizacije kozarcev in konzerviranja pekoče paprike v kuhalniku pod tlakom.
Ko so kozarci sterilizirani in ohlajeni, jih lahko ohlapno napolnimo s papriko. V kozarce nalijte vrelo vodo in prenehajte, ko je nivo vode 1 palec (2.54 cm) od roba kozarca. Postavite pokrove na kozarce, privijte trakove za zategovanje pokrovov in jih obdelajte v tlačni posodi po navodilih proizvajalca. Tako konzervirana paprika je varna za uživanje vsaj eno leto.