Čiščenje gob portobello vključuje več korakov, ki niso vsi potrebni ali včasih zaželeni. Stebla imajo zelo leseno teksturo in če jih odrežemo, jih lahko na drobno narežemo in ocvremo ali zamrznemo za kasnejšo uporabo v zelenjavni zalogi. Škrge ni treba vedno odstraniti, vendar jih je mogoče zlahka postrgati z žlico. Vrh gobovega klobuka, ki je običajno rjavkaste barve, lahko previdno odstranite, tako da ima portobello bled, čist videz, ko ga predstavite. Nobena od metod čiščenja ni res potrebna, z izjemo odstranitve škrg, če je goba prestara in so škrge pridobile neprijeten vonj.
Eno od področij zmede pri čiščenju gob portobello je, ali jih oprati v vodi. Medtem ko bodo gobe absorbirale majhno količino vode, to v resnici ni dovolj velika količina, da bi vplivala na okus, razen če gobo narežemo ali namakamo dlje časa. Glavni razlog za izogibanje potapljanju gob v vodo je ta, da se površina gobe poškoduje in pokvari videz, če jih ne uporabite zelo kmalu po pranju. Pri čiščenju gob portobello, ki jih ne boste uporabljali šele nekaj ur ali dni pozneje, je najbolje, da z vlažno krpo odstranite umazanijo s površine.
Škrge pod klobukom gobe portobello pogosto odstranimo, ker povzročijo temno barvo hrane, čeprav so škrge popolnoma užitne in lahko jedi dodajo zemeljski okus. Z lahkoto jih odstranimo tako, da gobo držimo obrnjeno in jih s konico žlice postrgamo. Če so se škrge odprle in imajo neprijeten vonj, jih je treba vsekakor odstraniti. Pri čiščenju škrg gobe portobello moramo biti previdni, saj lahko ob stiku z njimi še vedno postanejo temne deske za rezanje ali druga živila, čeprav se to običajno lahko spere, če jih hitro ujamemo.
Odstranimo lahko tudi površino na vrhu klobuka gobe. Tanko kožo lahko snamete v trakovih, običajno tako, da zgrabite majhen košček na zunanjem robu pokrovčka in ga povlečete navzgor. Deluje lahko tudi krtača za čiščenje gob ali krtača za zelenjavo. Glavni razlog za odstranitev lupine pri čiščenju gob portobello je ustvariti enotno predstavitev, ko jih uporabljamo v solatah ali belih omakah.