Streha rastlinjaka ni enaka velikosti za vse, učinkovito streho rastlinjakov pa je mogoče doseči s številnimi različnimi materiali. Najpogostejši materiali, ki se uporabljajo kot strehe za rastlinjake, so steklo, polietilenska folija, dvoslojne plošče iz polikarbonata ali akrila ter plošče ali folije iz steklenih vlaken. Vsak od teh materialov ima prednosti in slabosti, eden pa je morda bolj primeren za določeno vrsto rastlinjaka kot drugi. Vsak strešni material za rastlinjake ima eno zelo pomembno skupno lastnost: je prozoren ali polbister, svetlobno prepusten material, ki bo rastlinam v rastlinjaku omogočil, da prejmejo svetlobo in toploto, ki jo potrebujejo za rast.
Pri izbiri, kateri material je najboljši za streho rastlinjaka, bo graditelj želel upoštevati svoj proračun in vrsto rastlinjaka, ki bi ga želel zgraditi. Različni materiali so lahko boljši, odvisno od tega, ali bo rastlinjak majhen ali velik, ali pa gre za trajno ali poltrajno strukturo. Vrsta materialov za okvirje lahko vpliva tudi na najboljše materiale za streho rastlinjaka. Dobro izdelan načrt je dober prvi korak pri določanju, katera streha je najbolj primerna za rastlinjak.
Najbolj tradicionalna in trajna rešitev za streho rastlinjaka je steklo. Je najbolj prozoren in svetlobno prepusten material, ki je na voljo in je ob pravilni vgradnji lahko precej dolgotrajen. Steklo je pogosto najboljša izbira za trajne rastlinjake, solarije ali sončne sobe. Kaljeno steklo, ki je lahko do petkrat debelejše od običajnega stekla, predstavlja najmanjše tveganje za pokanje ali razbijanje. Streha rastlinjaka iz kaljenega stekla je lahko edini strešni material, ki lahko dolgo časa zadrži zelo težak, moker sneg, ne da bi se zrušil.
Steklena streha pa ima svoje pomanjkljivosti. Na splošno zahteva najvišje predhodne stroške, ne le zaradi stroškov stekla, ampak tudi zato, ker zahteva močne, trdne materiale za okvir, ki ga podpirajo. Paziti je treba na skrbno gradnjo in tesnjenje steklenih streh rastlinjakov, saj je pri tistih, ki niso pravilno zatesnjene, velika verjetnost puščanja. Steklo ima tudi večje tveganje lomljenja kot nekateri drugi materiali in ni najboljši izolator.
Plošče ali plošče iz steklenih vlaken so dolgotrajna in cenejša alternativa steklu in se lahko uporabljajo v trajnih rastlinjakih 15 let ali več. Ta material je veliko lažji od stekla, zato ne zahteva težkega okvirja na enak način kot steklena streha. Fiberglass je dovolj trpežna, da prenese številne vrste vremenskih in drugih zunanjih elementov. Sčasoma pa se bo prodiranje svetlobe tega materiala zmanjšalo; zahteva vzdrževanje, da se ohrani najboljša možna prepustnost svetlobe. Steklena vlakna tudi niso tako fleksibilna kot nekatere druge vrste strešne kritine za rastlinjake.
Polietilenska ali plastična folija je poceni, fleksibilna, lahko dostopna in enostavna za nanašanje toplogrednih oblog. Po preglednosti je lahko primerljiv s steklom, kar zagotavlja odlično prepustnost svetlobe. Kjer gre za majhne, začasne, prenosne ali sezonske rastlinjake, je polietilenska folija lahko hitra in enostavna rešitev za streho za rastlinjake. Prav tako je enostaven za uporabo v rastlinjakih z ukrivljenimi ali obokanimi strehami in se lahko uporablja v rastlinjakih z odprto ali odprto streho, kadar je potreben zložljiv material.
Nekatere vrste polietilenske folije so lahko dovolj trdne, da zdržijo do pet let, nekatere pa so bile obdelane z dodatki, ki pomagajo odbijati in oddajati toploto v rastlinjak. Po drugi strani pa filmske obloge niso tako trpežne kot steklo ali steklena vlakna, se lahko lažje poškodujejo kot drugi materiali in zahtevajo najpogostejšo zamenjavo. Malo verjetno je, da bodo dobra izbira za trajne rastlinjake.
Dvoslojna polikarbonatna ali akrilna kritina za rastlinjake, ki je praviloma izdelana z enako razporejenimi »mrežami« med obema slojema, zelo dobro zadržuje toploto. Morda je najboljši strešni material, ko gre za stroške energije ali nizke temperature. Je močnejši in vzdržljivejši od filma ter je lahko dovolj prilagodljiv za uporabo na ukrivljenih strehah. Je razmeroma dolgotrajen, včasih tudi do 10 let.
Po drugi strani pa dvoslojna konstrukcija ne prepušča toliko svetlobe kot steklo ali enoslojna steklena vlakna. Polikarbonatni materiali so lahko dovzetni za rumenenje, čeprav je akril manj verjetno, da bo porumenel. Ta vrsta materiala tudi ne bo trajala tako dolgo kot steklo ali steklena vlakna.