Na cene etanola lahko vplivajo številni različni dejavniki. To gorivo je odvisno od kmetijskega proizvoda, običajno koruze ali sladkorja, zato lahko cena teh osnovnih surovin pomeni veliko razliko, ko gre za določanje stroškov goriva za etanol. Drugi dejavniki, ki vplivajo na ceno etanola, vključujejo proizvodne stroške, stroške prevoza, davke ali tarife in subvencije. Nekateri od teh ustvarjajo pritiske na dvig cen, medtem ko drugi delajo na znižanju cen.
Da bi razumeli glavno vlogo, ki jo imajo cene kmetijskih proizvodov pri ceni plina etanola, je koristno vedeti, kaj vpliva na cene teh surovin. Pogoji rasti, kot so bolezni, vreme in razmere v tleh, pomembno vplivajo na ceno. Zakon ponudbe in povpraševanja uči, da če povpraševanje ostane enako ali raste, ponudba pa se zmanjša, se stroški povečajo. Zato, ko razmere zmanjšajo pridelek, se cena dvigne. V boljših letih se lahko cene etanola dejansko znižajo.
Čeprav je cena teh osnovnih gradnikov etanola pomembna, niso tako nestanovitna, kot si mnogi mislijo. Koruza in sladkor se pogosto kupujeta po pogodbi, s čimer se izognemo nekaterim dnevnim spremembam cen, ki se bodo zagotovo zgodile. Zato lahko cene etanola ostanejo razmeroma stabilne, tudi če so na trgu surovin velika nihanja. Ko se pogajajo o novih pogodbah, je verjetnost, da se bodo cene etanola spremenile zaradi posodobljenih cen surovin, večja.
Drug pomemben dejavnik pri določanju cen etanola so stroški prevoza. Etanol je treba prevažati v cisternah na vlakih in tovornjakih, ker je tako jedko. Zelo malo je cevovodov, ki so zasnovani za prenašanje takšnega materiala. Zato ima etanol višjo ceno v primerjavi z običajnim bencinom in oljem.
Stroški prevoza so nekoliko izravnani z dejstvom, da so marsikje za etanol uvedene subvencije in davčne olajšave. Takšne spodbude obstajajo, ker nekatere vlade želijo spodbujati uporabo etanola kot čistejšega goriva. To pomaga znižati cene etanola, čeprav umetno.
Ta umeten nadzor nad cenami lahko deluje v obe smeri. Tarife in drugi davki na etanol so tudi umetni vplivi na cene in pomagajo dvigniti ceno, zlasti ko gre za tuje vire etanola. Na primer, brazilski etanol bi bil veliko cenejši za nakup v Združenih državah, le da obstaja carina na njegov uvoz. Zaradi tega je cena brazilskega etanola enaka ali celo dražja od domačega etanola. To morda ne bo koristno za potrošnike, vendar pomaga zaščititi domačo industrijo.