Ko zvok pride v ušesa, ga obdelajo fizične komponente srednjega in notranjega ušesa ter slušni centri možganov. Na zaznavanje višine vpliva več dejavnikov, vključno z naravo obdelave zvoka v telesu. Nevronsko kodiranje v možganih vpliva na to, kako ljudje slišijo zvok. Prisotnost več zvokov, spremembe glasnosti ali frekvence zvočnih impulzov lahko vplivajo na zaznavanje višine. Teorije, ki so poskušale opredeliti zaznavanje višine, vključujejo teorijo krajev in časovno teorijo.
Zvok vstopi v uho in ga najprej obdela ušesni boben ali bobnič. Nato se prevede v premike v treh majhnih kosteh, preden preide v polž, spiralni organ v notranjem ušesu z lasnimi celicami, ki se premikajo z zvočnimi valovi. Gibanje dlak se prevede v signale, ki se prenašajo v slušni živec. Različni deli bazilarne membrane v notranjosti polža zajemajo različne frekvence, kot pojasnjuje teorija kraja. Ta teorija tudi opisuje, kako se visoki harmoniki, ki so blizu drug drugemu, ne zaznavajo kot ločeni.
Teoretiki so tudi špekulirali, da je zvok zaznan v razmerju s časom, znano kot časovna teorija. Živčne celice se sproščajo v periodičnih časovnih intervalih, služijo pa tudi za analizo frekvence. Kombinacija obeh teorij pomaga pri raziskovanju narave zaznavanja zvoka pri ljudeh. Nevronska aktivnost v slušni skorji močno vpliva na zaznavanje višine, pri čemer spremembe višine stimulirajo področja na desni hemisferi. Težave v desnih časovnih predelih možganov včasih vplivajo na to, kako lahko nekdo zazna spremembe višine.
Nezmožnost razumevanja spremembe tona je del gluhega tona. Ko se melodije prenesejo na različne tipke, se na splošno zazna relativna višina vsake note. Intenzivnost zvoka vpliva tudi na zaznavanje višine. Zaradi povečanja intenzivnosti visokofrekvenčnih zvokov bo zvenelo, kot da se višina tona dviguje. Zvišanje intenzivnosti nizkofrekvenčnih zvokov povzroči, da zvenijo, kot da se višina tona zmanjšuje.
Zvoki, ki utripajo ali trajajo, imajo tudi drugačno zaznavo višine. Zdi se, da imajo zvočni impulzi z upadajočo amplitudo v primerjavi z enakomernim pulzom višjo višino. Šumi in toni, ki se slišijo preko enega tona, lahko spremenijo tudi njegovo navidezno višino. Na zaznavanje višine torej vplivajo notranji in zunanji dejavniki. Zvok, ki ostaja stabilen v višini, se včasih zdi, da se spreminja, kot ga sliši človeško uho.