Na zadosten odmerek metotreksata vplivajo številni dejavniki, kot so specifično stanje, za katerega se zdravilo uporablja, starost bolnika in velikost bolnika. Na primer, odrasla oseba, ki jemlje zdravilo za zdravljenje revmatoidnega artritisa, zahteva 7.5 miligramov (mg) odmerka zdravila na teden. Otroku, ki jemlje zdravilo za isto stanje, je treba dati med 5 in 15 mg zdravila na kvadratni meter (m2) telesne velikosti. Zadostni odmerek metotreksata za odraslo osebo, ki jemlje zdravilo za limfom, natančneje Burkittov tumor v prvi ali dve fazi, je 10 do 25 mg na dan štiri do osem dni.
Najbolj očiten dejavnik, ki vpliva na zadosten odmerek metotreksata, je stanje, ki ga zdravilo zdravi. Na primer, če odrasel bolnik jemlje zdravilo za luskavico, mu je treba dati odmerek med 10 in 25 mg na teden, dokler se ne odzove na zdravljenje. Odrasel bolnik, ki jemlje zdravljenje za revmatoidni artritis, potrebuje le 7.5 mg na teden. Največji odmerek, ki ga lahko vzamete v enem tednu, je prav tako določen glede na stanje. Na primer, bolniki z luskavico lahko vzamejo do 30 mg na teden, bolniki z revmatoidnim artritisom pa do 20 mg na teden.
Starejši bolniki lahko na splošno prenesejo večji odmerek metotreksata kot mlajši bolniki, zato je starost pomemben dejavnik pri določanju zadostnega odmerka. Odrasli, ki jemlje zdravilo za neoplastične bolezni, lahko predpišemo vse od 30 mg na m2 telesne velikosti do 40 mg na m2 na teden. Ta se lahko dramatično poveča, do 12,000 mg na m2, če se zdravilo jemlje z levkovorinom. Otrokom lahko predpišemo le od 7.5 do 30 mg na m2, zdravljenje pa lahko dajemo le enkrat na dva tedna.
Metotreksat je zdravilo, ki ima lahko številne neželene učinke, nekateri od teh pa so lahko smrtni. Zdravilo lahko na primer povzroči smrt ali okvare pri nerojenih dojenčkih, zato ga nosečnice nikoli ne smejo jemati. Drugi možni smrtni neželeni učinki vključujejo supresijo kostnega mozga in okužbe pljuč. Zaradi teh resnih možnih reakcij sme odmerek metotreksata povečati le zdravnik, glede na bolnikov odziv na zdravljenje.
Te možne nevarnosti, povezane z zdravljenjem, pomenijo, da bo morda treba odmerek metotreksata spremeniti glede na bolnikovo telesno velikost. To je označeno z odmerki z oznako “na m2”. Preprost razlog za to je, da lahko večji bolniki prenesejo večje odmerke zdravljenja, preveliki odmerki pa lahko negativno vplivajo na manjše bolnike.