Za mnoge popotnike je javni prevoz najcenejši način prevoza. Kljub temu se lahko stroški javnega prevoza močno razlikujejo med destinacijami in celo znotraj mesta ali mesta. Dejavniki, ki vplivajo na stroške množičnega prevoza, vključujejo razpoložljivost davčnih sredstev za njegovo podporo, raven storitev in uporabljeni način javnega prevoza. Drug dejavnik, ki vpliva na stroške javnega prevoza, je zmožnost sistema javnega prevoza, da vzpostavi odnose z drugimi podjetji, od katerih lahko sistem pridobi prihodke za izravnavo svojih operativnih stroškov.
Javni prevoz je na splošno podprt s kombinacijo davčnih prihodkov, vozovnic ljudi, ki uporabljajo sistem, oglaševanja in včasih koncesij. Znesek prejetih davčnih prihodkov bo močno vplival na proračun za sistem javnega prevoza na območju in bo imel velik vpliv na vrste in obseg storitev, ki so na voljo. Z zadostnim davčnim financiranjem bi lahko množični tranzitni sistem nekega območja nudil celovite storitve skupnosti za razmeroma nizke cene. Brez zadostnega davčnega financiranja se lahko pričakuje, da bodo potniki plačevali višje cene za uporabo javnega prevoza in storitev, ugodnosti pa bi lahko bile omejene. Na primer, z minimalnim davčnim financiranjem lahko javni prevoz deluje samo podnevi in lahko obstajajo veliki deli skupnosti, ki jih javni prevoz ne oskrbuje.
Nekateri sistemi javnega prevoza aktivno iščejo partnerstva z zasebnimi podjetji. Tem zasebnim podjetjem bi lahko bilo dovoljeno najeti prostor na postajah javnega prevoza za prodajo hrane, revij ali drugega blaga in storitev. Sredstva, ki jih plačajo ti prodajalci, lahko znatno prispevajo k proračunu delovanja sistema množičnega prevoza. V drugih primerih se lahko podjetje za javni prevoz poveže z oglaševalskim podjetjem, ki prodaja oglasni prostor v vozilih in postajah javnega prevoza ali na njih. Ponovno bi lahko prihodki od tega oglaševanja pomagali tranzitnemu sistemu zmanjšati stroške javnega prevoza za njegove uporabnike.
Dodatni dejavniki, ki vplivajo na stroške javnega prevoza, vključujejo vrsto vozil, ki se uporabljajo v javnem prevozu, stroške osebja v vozilih in stroške goriva. Na nekaterih območjih so lahko na primer cene vozovnic za vlake višje od vozovnic za avtobuse zaradi stroškov vzdrževanja vlakov, tirov in plačila osebja, ki je potrebno za učinkovito in varno upravljanje vlakovnega sistema. Poleg tega lahko razlike v ceni goriva vplivajo tudi na stroške javnega prevoza; v obdobjih, ko so stroški goriva visoki, bo morda treba zvišati potniške vozovnice, da bi preprečili zmanjšanje storitev.