Odmerke fluoksetina določajo starost, stanje, ki se zdravi, in vrsta formulacije zdravila. Nanje vpliva tudi odziv pacienta, saj je to najbolj zanesljiv način za določanje učinkovitosti zdravila in odmerka. Bolniki lahko jemljejo druga zdravila, ki lahko vplivajo na odziv ali neposredno vplivajo na delovanje fluoksetina, ki se pogosto prodaja pod imenom Prozac®, in ga telo presnavlja. V teh primerih je morda potrebna prilagoditev odmerka.
Najprej je treba upoštevati starost bolnika in običajno se zdravilo ne daje otrokom, mlajšim od sedmih let. Otroci, starejši od sedmih do srednjih let, lahko prejemajo odmerke fluoksetina, ki se razlikujejo od 10 do 60 mg za stanja, kot so huda depresija, obsesivno-kompulzivna motnja (OCD) ali bulimija nervoza. Mlajši otroci običajno prejemajo nižje odmerke, vendar močno vpliva tudi stanje. Odmerek OCD se lahko povzpne na 60 mg pri populaciji, mlajši od 18 let, vendar odmerki za depresijo pri otrocih običajno ne presegajo 20 mg. Kot mnogi antidepresivi se tudi fluoksetin običajno začne z nižjim odmerkom in se v nekaj tednih poveča na vzdrževalni odmerek.
Starost vpliva tudi na količino odmerka na drug način. Če se fluoksetin uporablja pri geriatrični populaciji, so odmerki običajno manjši od odmerkov za “odrasle”. Priporočila za to populacijo so lahko bolj podobna priporočilom za otroke.
Odrasli z različnimi stanji jemljejo odmerke fluoksetina, ki deloma temeljijo na stanju in odzivu na zdravilo. Začetno zdravljenje se običajno začne pri 20 mg, čeprav je pri stanjih, kot je panična motnja, začetni priporočeni odmerek 10 mg. Pri hudi depresivni motnji se veliko bolnikov pozitivno odzove na začetni odmerek 20 mg, če pa ta ne zadostuje, se lahko odmerki povzpnejo na največ 80 mg na dan. Pri OCD imajo bolniki običajno terapevtske koristi z ravnmi zdravila od 20 do 60 mg, nekateri bolniki pa lahko vzamejo do 80 mg.
Posamezniki z bulimijo se običajno ne odzovejo na odmerke fluoksetina pod 60 mg. Za ženske s predmenstrualno disforično motnjo je priporočljiv zelo drugačen urnik odmerjanja. Vsak mesec pred začetkom menstruacije lahko jemljejo od 20 do 60 mg 14 dni.
Druga možnost odmerjanja je na voljo s tableto, znano kot “tedenski Prozac®”. To zdravilo je lahko primerno za ljudi, ki imajo stabilizirana stanja, za katere se zdi, da ne potrebujejo vsakodnevnega zdravljenja. Jemlje se enkrat na teden, običajno v odmerkih 20 mg.
Nekatera zdravila, ki se uporabljajo v kombinaciji s fluoksetinom, lahko vplivajo na način, kako se telo odzove na zdravilo ali odstrani. Eden od teh je olanzapin, atipični antipsihotik, ki se včasih predpisuje skupaj s fluoksetinom za odpravo depresije, odporne na zdravljenje, pri veliki depresivni motnji in bipolarni motnji. Modrost uporabe fluoksetina pri bipolarnosti je vprašljiva glede na njegov potencial za induciranje maničnih in hipomaničnih stanj, vendar praksa ni neznana. Terapevtski razpon za je od 25 do 50 mg, kadar se uporablja olanzapin, obe zdravili pa sta na voljo v kombinirani tableti.