Najpomembnejša dejavnika, ki vplivata na odmerjanje klonidina, sta bolnikovo osnovno stanje in odziv na zdravilo. Drug vpliven element je oblika, v kateri se zdravilo daje. Poleg tega lahko starost ali prisotnost drugih zdravstvenih stanj spremenita, kaj zdravniki menijo, da je ustrezna količina.
Klonidin najpogosteje zdravi hipertenzijo, vendar ima tudi številne neoznačene uporabe. Lahko se predpiše za motnjo pomanjkanja pozornosti s hiperaktivnostjo (ADHD), za bipolarno motnjo ali kot preventivo proti migreni. Druga možnost je, da zdravilo zdravi bolečino ali olajša odtegnitev od alkohola, opiatov ali benzodiazepinov. Ker so želeni učinki različni, se razlikuje tudi odmerek klonidina.
Za hipertenzijo je tipični začetni odmerek klonidina 0.2 miligrama (mg) na dan. Med nadaljevanjem zdravljenja se krvni tlak redno meri. Odmerek zdravila se lahko poveča s hitrostjo 0.1 mg na teden do 0.6 mg vsak dan. Jasno je, da je odziv bolnika prav tako pomemben kot stanje pri določanju pravega odmerka klonidina.
Otroci z ADHD, starejši od šestih let, lahko vzamejo tudi do 0.6 mg na dan. V večini primerov bodo uporabili veliko manj zdravila. Zlasti pri mlajših otrocih se lahko simptomi učinkovito zdravijo z 0.1 mg na dan.
Odmerek klonidina za bipolarno motnjo in druga stanja duševnega zdravja, kot so anksiozne motnje, je običajno 0.2 mg na dan. Za odtegnitev snovi se lahko bolniki umirijo z 0.1-0.2 mg. Preprečevanje migrene se pogosto doseže tudi z 0.2 mg.
Odmerki klonidina se lahko nekoliko razlikujejo glede na to, ali je v obliki tablet ali obliža. Kožni obliži, ki vsebujejo zdravilo, običajno dajejo 0.1 mg na dan. Ker je dostava transdermalna, ima zdravilo večjo biološko uporabnost in ta odmerek se šteje za enakovrednega 0.2 mg peroralno.
Kot je razvidno iz odmerkov v mikrogramih, je klonidin močno zdravilo. Pri nekaterih populacijah, na primer pri starejših, lahko uvedba zdravila v odmerku 200 mikrogramov ali 0.2 mg povzroči preveč neželenih učinkov. Kot splošna previdnost mora biti zdravljenje s tem zdravilom pri starejših bolnikih počasnejše. Podobno je treba odmerjanje klonidina pri ljudeh z ledvično (ledvično) boleznijo običajno začeti počasi, da se izognemo morebitnim negativnim reakcijam.
Pomemben je lahko tudi čas odmerjanja. Prvih nekaj dni klonidina lahko povzroči neprijetne simptome, kot sta omotica ali zaspanost. Bolniki imajo lahko manj stranskih učinkov, če zdravilo jemljejo ponoči, ko je njegovo spodbujanje zaspanosti pravzaprav prednost. Drugo vprašanje glede odmerjanja klonidina je, kako varno prenehati jemati zdravilo, kar lahko povzroči neželene učinke, če ga bolniki nenadoma prenehajo jemati. Da bi se izognili neprijetnim simptomom, je priporočljivo zmanjšati odmerek za več dni.