Na zadosten odmerek amoksicilina pri otrocih vpliva veliko dejavnikov, vključno s specifičnim stanjem, ki se zdravi, starostjo bolnika, telesno težo bolnika in njihovim odzivom na zdravljenje. Na primer, pediatrični bolniki, ki se zdravijo zaradi vnetja srednjega ušesa, stari od štirih mesecev do 12 let, potrebujejo od 20 do 50 miligramov (mg) na kilogram (kg) teže vsak dan. Če se bolnik zdravi za profilakso antraksa, se priporočeni odmerek dvigne na 80 mg na kg teže na dan. V večini primerov je zahtevani pediatrični odmerek amoksicilina izražen kot razpon, ki se nanaša na težo bolnika in njegov/njen odziv na zdravilo.
Teža je najpogostejši dejavnik pri določanju zadostnega odmerka amoksicilina pri otrocih. Večji bolniki potrebujejo večje odmerke zdravila, da dosežejo enak učinek. Iz tega razloga je večina odmerkov izražena na kg teže. To pomeni, da bo bolnik, ki tehta 50 kg, prejel približno dvakrat večji odmerek, kot ga bo prejel bolnik, ki tehta 25 kg. Spremembe v teži lahko zato povzročijo velike razlike v odmerkih.
Drug dejavnik, ki lahko vpliva na pediatrični odmerek amoksicilina, je bolnikov odziv na zdravilo. Nekateri bolniki imajo lahko naravno odpornost na številna zdravljenja z zdravili in zdravniki se lahko odločijo za povečanje odmerka tem bolnikom. Zato je večina pediatričnih količin amoksicilina navedenih kot razpon. Na primer, odmerek, potreben za pljučnico, je lahko med 40 in 50 mg na kg teže. Specifični odmerek v tem območju je določen z opaženimi učinki zdravila na posameznika.
Različna stanja zahtevajo tudi drugačen pediatrični odmerek amoksicilina. Če se zaradi tonzilitisa zdravi bolnik, star od štirih mesecev do 12 let, je zahtevani odmerek med 20 in 50 mg na kg na dan. Bolnik iste starosti, ki se zdravi za profilakso antraksa, bo prejel odmerek 80 mg na kg na dan. To je zato, ker se različna stanja odzivajo na različne količine penicilinskih antibiotikov.
Nekatera stanja imajo različne zahteve za pediatrični odmerek amoksicilina glede na starost bolnika. Na primer, bolnik v starosti od štirih tednov do treh mesecev, ki se zdravi zaradi okužbe sečil, bo prejel med 20 in 30 mg amoksicilina. Bolniku, staremu od štirih mesecev do 12 let, lahko damo karkoli med 20 in 50 mg zdravila. To je zato, ker so starejši bolniki bolj odporni na zdravljenje z zdravili.