Imeti kakovostno podtalnico pomeni več kot le čisto vodo. Upošteva tudi vsebnost mineralov v vodi. Kakovost podzemne vode je pod nadzorom številnih dejavnikov, vključno z onesnaževanjem, vendar obstajajo trije glavni dejavniki, ki prispevajo k kakovosti podzemne vode: podnebje, globina vode ter tla in usedline.
Prvi dejavnik je podnebje območja. Na toplejšem območju, kjer je manj padavin, voda hitreje izhlapi, ko se približa površini tal. Voda hitro izhlapi, minerali pa ostanejo v tleh. Ko naslednjič dežuje in se voda vpije v zemljo, voda vsrka minerale in jih odnese v vodovod ter ji da slan okus. Hladnejše območje, kjer je veliko padavin, bo imelo manj mineralov v vodi, kar bo izboljšalo kakovost podzemne vode.
Drugi dejavnik, ki nadzoruje kakovost podzemne vode, je globina podzemne vode od površine. Z globljim nivojem vode bo manj onesnaženja, saj onesnaževalci težje pridejo do vode. Vendar pa bo globlja voda imela višjo vsebnost mineralov. Voda deluje tako, da raztopi vse, s čimer pride v stik, zato, ko se pogrezne globlje v zemljo, raztaplja minerale in jih prenaša proti oskrbi z vodo.
Zaloge plitke vode ne bodo tako mineralizirane, ker voda ne pade tako globoko. Vendar pa ima višjo raven kalcija, železa in magnezija, ker zemlja nima toliko časa, da jih odstrani. Zaradi tega je voda “trda”. Plitva voda ima tudi večjo verjetnost, da bo prizadeta zaradi kontaminacije.
Tretji dejavnik, ki nadzoruje kakovost podzemne vode, je vrsta tal in usedlin na tem območju. Nekatere vrste usedlin vsebujejo kemikalije in minerale, kot je žveplo, ki se hitro raztopijo, kar povzroči višjo vsebnost mineralov v vodi. Druge vrste usedlin imajo manj vsebine, ki se zlahka raztopi in prenese v vodovod.
Drug vidik kakovosti podzemne vode, ki jo nadzira vrsta tal, je prepustnost tal. Pesek, ki ima visoko prepustnost, omogoča, da se voda zlahka premika po njem, kar preprečuje, da bi voda na svoji poti pobrala veliko mineralov. Manj prepustna tla, kot je glina, upočasnijo vodo, kar ji daje možnost, da raztopi več mineralov. Vendar, ko se voda počasi premika skozi tla, obstaja večja možnost, da za seboj pusti onesnaževala in druge onesnaževalce, kar ustvarja čistejšo oskrbo z vodo.