Glavni dejavniki, ki določajo odmerek hidrokortizona, so vrsta in resnost bolezni, ki se zdravi, ter velikost bolnika. Večja kot je velikost bolnika, več zdravila bo potrebno za proizvodnjo želene ravni v krvi. Posledično se odraslim predpisujejo veliko večje odmerke kot otroci. Odmerek se bo razlikoval tako po načinu dajanja kot tudi po velikosti. Akutne življenjsko nevarne motnje bodo zahtevale intramuskularno ali intravensko injekcijo, medtem ko se neakutne bolezni lahko zdravijo s peroralnim odmerkom. Za zdravljenje kožnih bolezni se uporablja tudi lokalno s hidrokortizonsko kremo ali mazilom, za lajšanje kolitisa pa se lahko daje rektalno v obliki suspenzije.
Eden od pogojev, za katerega se uporablja to zdravilo, je adrenokortikalna insuficienca, ki je neuspeh nadledvičnih žlez, da proizvedejo dovolj steroidnih hormonov. Odmerek hidrokortizona za odrasle je 100 mg intravensko, čemur sledi 300 mg na dan v segmentiranih količinah ali kot 48-urna infuzija. Ko se bo odrasli bolnik izboljšal, bo odmerek prešel na peroralno, 50 mg trikrat na dan, kasneje pa se bo odmerek zmanjšal na 30 do 50 mg enkrat na dan. Majhnim otrokom s tem stanjem bodo sprva dajali intravensko 1 do 2 miligrama/kilograma (mg/kg), nato se bo odmerek zmanjšal na 25 do 100 mg na dan v segmentiranih količinah. Starejši otroci bodo sprva prejeli injekcijo hidrokortizona, nato pa jim bodo kasneje predpisali peroralni odmerek 30 do 50 mg na dan v razdeljenih količinah.
Odmerek hidrokortizona za odrasle za zdravljenje vnetja se lahko daje intravensko, intramuskularno ali peroralno. Običajno je predpisan od 15 do 240 mg na dan. Priporočeni peroralni odmerki za majhne otroke z vnetjem so 2.5 do 10 mg/kg na dan v segmentiranih količinah. Intravenski ali intramuskularni odmerki za to starostno skupino so običajno 1 do 5 mg/kg na dan. Protivnetni odmerek za starejše otroke je peroralna, intramuskularna ali intravenska uporaba 15 do 240 mg dvakrat na dan.
Druga bolezen, ki jo to zdravilo uporablja za zdravljenje, je šok, ki je nujno stanje, ki nastane zaradi neustreznega pretoka krvi v telesu. Tipičen odmerek hidrokortizona za odrasle je 500 mg do 2 grama (g) intravensko, štiri do 12-krat na dan. Otroci v šoku dobijo dva začetna odmerka po 50 mg/kg intravensko, v razmaku štirih ur. Odmerek za otroke se kasneje po potrebi zmanjša na enkrat na dan. Mladostnikom v šoku predpišemo 500 mg do 2 g, štiri do 12-krat na dan.
Astmo, ki je motnja, ki vključuje dihalne poti, je mogoče zdraviti s hidrokortizonom. Odmerek hidrokortizona za odrasle je običajno 100 do 500 mg intravensko, štirikrat na dan. Zdravljenje otrok z akutno astmo lahko vključuje polnilni odmerek 4 do 8 mg/kg intravensko. Vzdrževalni odmerek za otroke je 2 mg/kg štirikrat na dan.
Ulcerozni kolitis, vnetno stanje, ki prizadene debelo črevo, je mogoče ublažiti s tem zdravilom. Odmerek hidrokortizona za odrasle je običajno dajanje 100 mg rektalne suspenzije vsak večer 21 dni. Hudi primeri bolezni bodo morda potrebovali dva do tri mesece zdravljenja. Če je trajanje tega zdravljenja daljše od 21 dni, ga je treba počasi prekiniti z zmanjšanjem odmerka hidrokortizona na enkrat vsakih 48 ur v trajanju od dveh do treh tednov.