Vsako posamezno zdravljenje proktitisa je neposredno odvisno od vzroka samega proktitisa, kot je spolno prenosljiva bolezen ali obsevanje. Zdravljenje proktitisa lahko vključuje ozdravitev okužbe ali prenehanje jemanja zdravil, ki bi lahko povzročila vnetje. Za zdravljenje bolezni se lahko predpišejo tudi antibiotiki, supozitorije in druga zdravila.
Kadar je vzrok za vnetje sluznice rektuma povezana s spolno prenosljivimi boleznimi (STD), se bolniku običajno dajejo antibiotiki. To se naredi za odpravo tako bolezni, če je mogoče, kot tudi vnetja. Druga specifična zdravila za spolno prenosljive bolezni se lahko dajejo tudi kot zdravljenje proktitisa, odvisno od obolele bolezni.
Crohnovo bolezen, ulcerozni kolitis in druge bolezni, ki lahko povzročijo proktitis, se običajno zdravijo z zdravili na recept. Lahko jih jemljete kot klistir ali supozitorije. Včasih se lahko skupaj z eno od teh metod predpiše peroralno zdravilo. Če je vzrok za proktitis sevalna terapija, ki se ne more končati, lahko zdravljenje vključuje zdravila, ki bolniku pomagajo ustaviti krvavitev, in zdravila, ki pomagajo uničiti poškodovano tkivo, ki povzroča vnetje.
Če je vzrok za vnetje okužba, bo predpisano zdravilo odvisno od vrste okužbe. Za boj proti okužbi in proktitisu se običajno dajejo protivirusna zdravila ali antibiotiki. Če vnetje povzroča razdraženo črevesje, lahko zdravljenje proktitisa povzroči operacijo, čeprav zdravniki običajno poskušajo izčrpati vse druge vrste zdravljenja, preden se zatečejo k operaciji. Protivnetna zdravila lahko pogosto pomagajo bolnikom pri obvladovanju proktitisa in jim pomagajo pri izogibanju operaciji.
V primerih blagega do hudega neugodja zdravljenje proktitisa običajno vključuje kreme ali druga zdravila za lajšanje bolečine. Te so lahko na recept ali pa so na voljo brez recepta. Prehranska dopolnila z vlakninami in mehčalci blata se lahko dajejo tudi za lajšanje ali preprečevanje bolečine, kot tudi splošna zdravila proti bolečinam brez recepta.
Nekatere vrste zdravljenja proktitisa so lahko tudi naravne. Bolniki z manjšo bolečino ali tisti, ki se želijo vzdržati uporabe drog, se lahko za zdravljenje simptomov udeležijo sedeče kopeli ali potopijo v toplo vodo v majhen sedež nad straniščem. Uživanje diete z nizko vsebnostjo ostankov ali posebne skupine živil, ki je zasnovana tako, da povzroči najmanjšo možno količino blata, je še eno možno naravno zdravljenje. Bolnikom prav tako svetujemo, naj ne jedo pred spanjem, da se izognejo simptomom proktitisa.