Zastrupitev s školjkami povzročajo toksini, ki vstopijo v školjke v vodi pred nabiranjem. Zastrupitev s školjkami je manj pogosta kot alergija na školjke, ki lahko človeka tudi poškoduje ali ubije. Bolezni, ki jih povzročajo toksini školjk, so paralitične, nevrotoksične, driske in amnezične narave. Skrbno opazovanje okolja školjk lahko prepreči uporabo okuženih školjk za prehrano ljudi.
Paralitično zastrupitev s školjkami (PSP) povzroča toksin, ki ga sproščajo alge, najdemo pa ga v školjkah. Simptomi se začnejo v nekaj minutah po zaužitju okužene školjke in vključujejo glavobol, omotico, mravljinčenje, slabost, bruhanje in drisko. Mišična oslabelost lahko oteži požiranje in lahko celo poslabša dihanje. Še posebej ogroženi so bolniki, ki vsak dan potrebujejo respirator za dihanje. Bruhanje se lahko izzove, če bolnik ni prešibek, simptomi pa običajno izginejo v šestih do dvanajstih urah.
Zastrupitev s školjkami z drisko (DSP) povzročajo toksini, ki jih proizvajajo alge. Tako kot PSP ga običajno najdemo pri školjkah. Simptomi se začnejo takoj po zaužitju in vključujejo hudo drisko in bolečine v trebuhu. Zdravljenje je podporno, simptomi pa izginejo v enem do dveh dneh. Smrt se zgodi redko, in če se zgodi, je to posledica dehidracije.
Nevrotoksično zastrupitev s školjkami (NSP) najdemo tudi pri školjkah. Simptomi se pojavijo eno do tri ure po zaužitju. Ti simptomi vključujejo odrevenelost in mravljinčenje obraza, ust in okončin, preobrat občutka vročega in mraza, kjer vroče snovi občutijo hladno, hladne pa vroče in izgubo koordinacije. Pogosto se pojavijo tudi blagi do zmerni prebavni simptomi. Zdravljenje je podporno. O smrtnih primerih zaradi NSP niso poročali.
Amnezična zastrupitev s školjkami (ASP) je zelo redka bolezen, ki jo povzroča toksin, ki ga najpogosteje najdemo v školjkah, školjkah in rakih. Simptomi se pojavijo približno 24 ur po zaužitju in vključujejo bolečine v trebuhu, bruhanje, drisko, glavobol, razbijanje srca in kratkotrajno izgubo spomina. V primeru hude zastrupitve se lahko pojavijo napadi, koma in smrt. Zdravila ni, zdravljenje pa je strogo za zagotavljanje udobja bolniku.
Toksini, ki povzročajo zastrupitev s školjkami, nimajo vonja ali okusa. Ne uničijo se s čiščenjem, kuhanjem ali zamrzovanjem. Da bi preprečili zastrupitev pri ljudeh, je pomembno skrbno testiranje vode v bližini ležišč školjk. Ker te toksine proizvajajo morske rastline najpogosteje poleti in zgodaj jeseni, bo izogibanje školjkam v teh časih zmanjšalo tveganje za njihovo zaužitje.