Medicinski odpadki so nesrečen stranski produkt delovanja bolnišnice, zdravniške ordinacije, zobozdravstvene ordinacije ali zdravstvene ambulante. Različne telesne tekočine, trdne snovi in kirurške instrumente je treba odstraniti na poseben način, da ne bi onesnažili okolja in ne širili bolezni. Obstajajo štiri primarne službe za medicinske odpadke, ki ravnajo z vrsto odpadkov iz teh institucij. Sežig, parna sterilizacija, odlaganje v kanalizacijski sistem in ravnanje zunaj kraja poskrbijo za posebne vrste odpadkov.
Sežig je ena najpogostejših in najstarejših oblik storitev medicinskih odpadkov, ki so na voljo medicinski skupnosti. Ta storitev se izvaja bodisi v prostorih velike zdravstvene ustanove, kot je bolnišnica, ali pa jo izvaja podjetje za ravnanje z medicinskimi odpadki. Sežigalnica medicinskih odpadkov je velika peč, ki doseže tako visoko temperaturo, da se vsi mikrobi, mikrobi in bakterije uničijo skupaj s fizičnim predmetom, ki vstopi v ogenj. Običajno je sežig rezerviran za patološke odpadke, kot so deli telesa in organi, ker obstaja malo drugih metod za varno odstranjevanje teh predmetov.
Parna sterilizacija je še ena metoda ravnanja z medicinskimi odpadki, s katerimi skoraj vse ustanove ravnajo same. Te storitve medicinskih odpadkov se pogosto izvajajo za preprečevanje mikroorganizmov in kontaminiranih kirurških orodij. Sterilizacija s paro je sestavljena iz postavitve okuženih predmetov v veliko kovinsko posodo, ki se zapre. V notranjosti posode se uporabljata parni tlak in toplota, podobno kot lonec na pritisk, škodljiva sredstva pa se nevtralizirajo z visoko temperaturo. V primeru medicinskih instrumentov so ti predmeti dejansko varni za ponovno uporabo.
Številni stranski produkti medicinskih odpadkov niso zelo nevarni in jih je mogoče ponovno uvesti v splošni javni sistem odpadkov. Tekoči odpadki, kot so človeška kri in tekočine, se kemično obdelajo in sprostijo v kanalizacijski sistem za nadaljnjo obdelavo v napravi za čiščenje odplak. Te storitve ravnanja z medicinskimi odpadki običajno izvaja zdravstvena ustanova, ker je postopek razmeroma preprost in je stopnja nevarnosti nizka.
Končno, številne kompleksne storitve medicinskih odpadkov izvajajo profesionalna podjetja za odstranjevanje odpadkov zunaj kraja. Te organizacije so specializirane za ravnanje z odpadki na čist in profesionalen način. Ta podjetja se pogosto ukvarjajo z velikimi količinami odpadkov, ki jih zdravstvene ustanove ne morejo ravnati, kot so kri in človeški ostanki. Ti ponudniki storitev imajo na voljo več načinov za odstranjevanje teh potencialno škodljivih elementov. Ena od možnosti, ki jo ponujajo ta podjetja, je sežig v velikem obsegu, druga pa je varno zapiranje in zakopavanje odpadkov na varnih odlagališčih.