Poleg šifriranja sporočila, ki ščiti vsebino sporočila, je pogosto zaželeno skriti sam obstoj sporočila. Steganografija je znanost o skrivanju podatkov v podatkih, tako da sporočila ni enostavno najti. Nekatere vrste steganografskih orodij vključujejo besedilna orodja, ki skrijejo sporočila v črkah besedila; kodiranje IP paketov v glavah datotek; in skrivanje sporočil v slikah ali zvočnih datotekah.
Obstaja veliko različnih orodij za steganografijo, ki temeljijo na besedilu. To so običajno nizkotehnološke metode, pri katerih je besedilo urejeno, oblikovano ali selektivno izbrano, da razkrije nek skriti pomen. Kot preprost primer, običajna steganografska shema vključuje izbiro fiksne črke iz vsake besede v običajnem sporočilu, da se sestavi skrito sporočilo. Druga možnost vključuje prekrivanje maske na rubriko besedila, da se razkrijejo črke ali besede, ki vsebujejo skrito sporočilo.
Neuporabljeni biti glave internetnega protokola (IP) v paketih odprtih sistemskih povezav (OSI) se lahko uporabljajo tudi kot orodja za steganografijo. Uporabniki lahko izkoristijo prednost neuporabljenih bitov glave IP v omrežnem sloju OSI, kot so biti Don’t Fragment (DF) ali Več fragmentov (MF), da ustvarijo skriti kanal, prek katerega se lahko prenašajo informacije v podatkovnih paketih OSI. Ena od prednosti tega pristopa je, da so paketi običajno ločeni in pomešani med ogromno količino drugih paketov, ki niso povezani s sporočilom. Če en paket med milijoni pretočnih paketov, na primer, vsebuje elemente skritega sporočila in je skrito sporočilo samo razbito med številne takšne pakete, odkrivanje sporočila ne bi bilo lahko.
Orodja za slikovno in avdio steganografijo so postala zelo priljubljena zaradi interneta. Slikovne in zvočne datoteke na internetu so razširjene in običajno dovolj velike, da skrijejo veliko vdelane vsebine. Obstaja celo komercialno dostopna programska oprema, ki lahko prerazporedi najmanjši pomemben bit (LSB) bajtov, ki vsebujejo slikovne in zvočne digitalne datoteke, da bi vdelali sporočila. Čeprav sprememba teh bitov poslabša kakovost slike ali zvoka, je poslabšanje običajno dovolj majhno, da ni opazno s prostim očesom. Ta steganografska tehnika pa pušča zaznaven statistični podpis. Uporabniki lahko prikrijejo podpis z uporabo naključnih kriptografskih ukrepov, vendar bi ga izkušen kriptograf verjetno lahko zaznal.
Steganografske dejavnosti na splošno močno podpirajo ogromne količine podatkov, ki se pretakajo v sodobni družbi. Vsak del tega podatkovnega toka lahko nosi skrite, vdelane podatke. Steganografske varnostne protiukrepe pogosto ovira dejstvo, da čeprav obstaja tehnologija za pregledovanje pretoka podatkov za steganografske podpise, lahko poskusi upočasnijo pretok podatkov, da se ne izplačajo.