Ker so računalniški virusi, vohunska programska oprema in druge zlonamerne elektronske dejavnosti postale vse bolj običajne, je bilo razvitih veliko vrst računalniških varnostnih orodij za zaščito sistemov pred nezaželenimi vdori. Uporabniki računalnikov lahko izbirajo med požarnimi zidovi, protivirusno programsko opremo in blokatorji vohunske programske opreme, ki pomagajo pri iskanju in odpravljanju škodljive kode. Zaskrbljeni uporabniki bodo morda želeli uporabiti spletne storitve generiranja in pridobivanja gesel ali overitelje za pomoč pri zaščiti spletnih računov pred ogroženostjo. Mnoga podjetja zahtevajo višjo raven varnosti za občutljive podatke in lahko najamejo osebje strokovnjakov za elektronsko varnost ali privabijo svetovalce, ki pomagajo pri namestitvi in vzdrževanju varnega omrežja.
Od nastanka omrežnega računalništva so virusi nenehno ogrožali varnost in zanesljivost računalniških sistemov. Medtem ko se večina virusov širi prek interneta in drugih omrežij, se lahko nahajajo tudi na izmenljivih napravah za shranjevanje, kot so kompaktni diski (CD) in naprave z univerzalnim serijskim vodilom (USB). Varnostni strokovnjaki so zasnovali računalniška varnostna orodja, znana kot protivirusni programi, da bi našli in odstranili elektronske viruse iz računalnikov. Ti programi delujejo tako, da skenirajo datoteke v računalniku in jih primerjajo s knjižnico znanih virusov. Virusi so nato v karanteni in izbrisani iz sistema.
Programska oprema za odkrivanje oglasne in vohunske programske opreme deluje na podoben način kot protivirusni programi, vendar se ta računalniška varnostna orodja osredotočajo na iskanje in odstranjevanje programov, ki spremljajo dejavnosti uporabnikov ali silijo uporabnike, da si ogledajo neželeno oglaševanje. Ti programi običajno skenirajo manjše območje trdega diska uporabnika in jih je mogoče nastaviti na neprekinjeno delovanje, da blokirajo zlonamerno kodo s spletnih mest. Ta orodja so pogosto brezplačna, zaradi česar mnogi uporabniki za dodatno varnost uporabljajo več kot eno vrsto detektorja vohunske programske opreme na svojem računalniku.
Poleg teh programov za odkrivanje so številni sistemi zaščiteni pred neželenimi vdori z računalniškimi varnostnimi orodji, znanimi kot požarni zidovi. Ta orodja delujejo tako, da filtrirajo vrsto vsebine, ki je dovoljena za prehod v računalnik, in blokirajo neželene povezave. Požarni zid je lahko prisoten v operacijskem sistemu računalnika ali kot del vdelane programske opreme omrežnega usmerjevalnika. Večina omrežij mora imeti nameščen vsaj en požarni zid, ki jih zaščiti pred nepooblaščenim vstopom.
Ker vse več finančnih dejavnosti poteka prek elektronskih medijev, so mnogim uporabnikom ukradli gesla in vdrli v spletne račune. Mnogi uporabniki imajo težave pri ustvarjanju in zapomnitvi močnih gesel, zato nekatera podjetja ponujajo spletne storitve, ki bodo ustvarile edinstvena gesla in jih shranile za uporabnika. Druga podjetja zagotavljajo avtentikatorje, ki delujejo v kombinaciji s sistemom gesel za preverjanje identitete uporabnika. Ta računalniška varnostna orodja so uporabna za potrošnike, ki imajo veliko spletnih računov ali potrebujejo dodatno varnost za zaščito svojih sredstev.