Obstaja več šol razmišljanja o namestitvi protivirusne programske opreme za Ubuntu®, eno najbolj priljubljenih namestitev operacijskega sistema Linux, ki je na voljo od leta 2011. Na internetu obstajajo virusi, vohunska in zlonamerna programska oprema, ki bodo delovali in bi lahko ogrozili namestitev Ubuntu®, če niso sprejeti ustrezni varnostni ukrepi. Predvsem sta za operacijski sistem na voljo dve vrsti protivirusne programske opreme. Ena preprečuje začetno okužbo, druga pa odstrani že nameščeno programsko opremo. Uporaba obeh vrst v tandemu lahko pomaga povečati že tako močno varnost, ki jo uživa programska oprema Linux.
Operacijski sistem Linux že dolgo velja za zelo varen. To je deloma posledica prakse, da se za izvajanje programov ali dostop do informacij zahtevajo ustrezna sistemska dovoljenja. Zelo dolgo ni bilo protivirusne programske opreme za Ubuntu®, ker se je menilo, da ni potrebna. Veljalo je, da bodo dovoljenja operacijskega sistema preprečila zagon zlonamerne programske opreme. Spletni brskalniki so nato postali bolj zapleteni in postalo je bolj verjetno, da bi heker lahko napisal program v jeziku spletne aplikacije, ki bi našel način, da se izvede v sistemu Ubuntu® in ogrozil varnost.
Ena glavnih vrst protivirusne programske opreme za Ubuntu® je optični bralnik prenosov ali skener datotek. To je del programske opreme, ki si ogleda datoteko, ki si jo ogledate v spletu, preden se naloži v spletni brskalnik ali drug program, ali pa pogleda datoteko, ki je bila prenesena, vendar ni ekstrahirana. To deluje tako, da poskuša prepoznati podpis računalniškega virusa. Podpis je ločen del računalniške kode, kot je prstni odtis, ki kaže, da je bil virus vdelan v datoteko. Naprednejša protivirusna programska oprema ima lahko v notranjosti knjižnico, ki lahko ekstrahira škodljiv virus in popravi izvirno datoteko, zaradi česar je varna za uporabo.
Druga vrsta protivirusne programske opreme za Ubuntu® je namenjena skeniranju skritih ali manj kot očitnih območij v datotečnem sistemu, da bi poiskali viruse, ki so že bili vsajeni v gostiteljski sistem. To je včasih lahko zelo težko odstraniti, ker bo toliko varnostnih funkcij zaobšlo ali prekoračeno, morda tako, da uporabnika zavede, da zlonamerni programski opremi dodeli dovoljenja na visoki ravni. Protivirusna programska oprema za Ubuntu® lahko pregleda imeniško strukturo datotečnega sistema in išče znane datoteke ali sledi datotek, ki bi lahko kazale, da je virus prisoten ali je bil priložen obstoječim datotekam. V večini primerov ga je mogoče odstraniti, vendar obstajajo določene vrste računalniških virusov, ki lahko preprečijo drugi programski opremi, da odstrani okužene datoteke.