Programska oprema za posebno izobraževanje lahko otroke nauči spretnosti ali pomaga pri upravljanju njihovih izobraževalnih podatkov v šolah s posebnimi izobraževalnimi programi. Obstajajo različne vrste programov, ki otrokom pomagajo okrepiti svoje bralne, govorne in pisne sposobnosti. Na voljo so tudi programi, ki otrokom pomagajo izboljšati svoje matematične sposobnosti. Ti programi vključujejo igre in priložnosti za otroke, da vadijo veščine, ki jih bodo potrebovali tako v življenju kot v šoli.
Programska oprema za matematične spretnosti lahko otroke uči z igrami ali glasbo. Učenci s posebnimi potrebami se lahko naučijo šteti in se naučijo osnovnih matematičnih veščin z uporabo interaktivnih programov, ki jim omogočajo manipuliranje predmetov na računalniku. Lekcije množenja, seštevanja in odštevanja so značilne za programsko opremo za matematične veščine. Poleg tega lahko otroci vadijo, kar so se naučili, z uporabo delovnih zvezkov, ki so priloženi programski opremi.
Programska oprema za tipkovnico pomaga otrokom s posebnimi potrebami tipkati po računalniku. Ta programska oprema lahko pomaga otrokom z disleksijo, motnjo pomanjkanja pozornosti in avtizmom, da se naučijo tipkati. Glede na otrokovo invalidnost lahko program poučuje tipkanje v kratkih vajah, kar otroku ponuja priložnost, da vadi, kar se je naučil. Otroci z disleksijo lahko uporabljajo programsko opremo, ki jim pomaga vaditi tipkanje brez prestavljanja črk. Programska oprema je lahko učinkovita tudi pri pomoči otrokom, ki imajo običajno težave s pravilnim pisanjem.
Posebna izobraževalna programska oprema za jezikovne veščine bi lahko uporabljala glasbene in govorne vaje, da bi otrokom pomagala pri razvoju in izboljšanju spretnosti brčnega razumevanja, izgovorjave in slovnice. Nekateri programi uporabljajo slike in zvok, kar od njih zahteva, da prepoznajo slike in izgovorijo besede, potem ko slišijo poziv. Programska oprema za jezikovne umetnosti lahko otroke s posebnimi potrebami nauči pravilno uporabljati besede v celotnih stavkih. Nekateri jezikovni umetniški programi poučujejo z uporabo interaktivnih iger, v katerih otroci pridobivajo točke s pravilnimi odgovori. Starejši otroci se lahko naučijo pisati eseje s programsko opremo, ki jim pomaga pri raziskovanju, organiziranju, pisanju in urejanju.
Učitelji, ki delajo v učilnicah, kjer so učenci s posebnimi potrebami, lahko uporabljajo posebno izobraževalno programsko opremo za spremljanje doseganja ciljev ter prilagoditev in sprememb, ki so potrebne za vsakega otroka. Programska oprema se pogosto uporablja za izdelavo individualnega izobraževalnega načrta (IEP) za študente v posebnih izobraževalnih programih. Dodatni programski paketi za posebno izobraževanje lahko pomagajo otrokom z vedenjskimi ali socialnimi težavami.
Programska oprema pogosto vsebuje učne načrte, ki se osredotočajo na razvoj spretnosti za reševanje problemov. Nekateri programski sistemi zahtevajo, da otroci gledajo multimedijske predstavitve zgodb in odgovarjajo na vprašanja, povezana z njimi. Otroci se naučijo, kako izboljšati svoje procese odločanja. Funkcionalne veščine, kot so prošnja za pomoč, izražanje pritožbe ali obvladovanje pritiska vrstnikov, so nekatere od veščin, ki jih obravnavajo programi za funkcionalne veščine.