Odvisno od naprave lahko programska oprema mobilnega računalnika vključuje tradicionalne programske aplikacije, ki jih najdete na namiznem računalniku. Te vrste programske opreme vključujejo operacijski sistem, aplikacije za poslovno produktivnost in internetne brskalnike. Pogoste so tudi mobilne aplikacije, usmerjene v posebne namene. Te aplikacije vključujejo igre, glasbo, družabna omrežja in orodja za načrtovanje.
Število mobilnih računalniških programskih aplikacij se še naprej povečuje, saj se povečuje priljubljenost mobilnih naprav. Aplikacije za pametne telefone so razvite za hiter dostop do skoraj vseh večjih spletnih mest ali internetnih storitev. Številne od teh aplikacij so usmerjene v novice, zabavo in družabna omrežja. Različne aplikacije za družbena omrežja, nameščene na mobilnih napravah, omogočajo uporabnikom interakcijo z glavno platformo spletnega mesta.
Uporabniki lahko pridobijo popolno funkcionalnost, vnašajo posodobitve statusa in delijo povezave na več različnih spletnih mestih za družbena omrežja. Morda bodo lahko klepetali z drugimi uporabniki iz svojih mobilnih naprav, običajno prek funkcij klepeta na spletnem mestu družbenih omrežij. Nekateri pametni telefoni so opremljeni z ekskluzivno funkcijo klepeta ali hitrega sporočanja, ki jo lahko uporabljajo tisti, ki so lastniki določene blagovne znamke telefona. Drugi pametni telefoni imajo nekatere ekskluzivne aplikacije, povezane z glasbo ali digitalnimi foto galerijami.
Glasbene aplikacije, ki shranjujejo in prenašajo digitalne glasbene datoteke, so druga vrsta programske opreme za mobilne naprave. Poleg digitalnih glasbenih knjižnic in predvajalnikov lahko aplikacije vključujejo dostop do satelitskega ali internetnega radia. Številni mobilni telefoni imajo obe možnosti in uporabnikom omogočajo skupno rabo in prenos datotek na druge računalnike, ki imajo isto aplikacijo. Na primer, če ima posameznik določene glasbene datoteke MP3, shranjene v spletni digitalni glasbeni knjižnici, lahko do njih dostopa iz aplikacije za mobilni telefon in jih posluša s pametnega telefona.
Priljubljena kategorija programske opreme za mobilne naprave so orodja za produktivnost in načrtovanje. Ta kategorija vključuje koledarje, lahke urejevalnike besedil, e-pošto in lahke aplikacije za shranjevanje. Uporabniki bodo morda lahko shranili občutljive podatke, niz telefonskih številk ali vrsto seznamov opravil. Paketi programske opreme za mobilne računalnike, ki spadajo v to kategorijo, lahko posameznikom omogočijo dostop do spletnih e-poštnih računov in integracijo koledarjev sestankov iz drugih namiznih računalnikov, ki jih morda imajo.
Igre so trendovska oblika mobilnih računalniških programskih aplikacij. Številne mobilne naprave so opremljene z dostopom z enim dotikom do spletnih mest za igre na srečo in uporabnikom omogočajo prenos iger. Na voljo so tradicionalne igre, ki so priljubljene pri samostojnih igralnih napravah, pa tudi naslovi, ekskluzivni za internet.
Ker mobilne naprave postajajo vse bolj izpopolnjene, mnoge od njih prihajajo z lastnimi operacijskimi sistemi. Nekatere naprave so opremljene s tradicionalnimi operacijskimi sistemi, ki jih vidimo na namiznih računalnikih. Druge so lažje različice dobro znanih sistemov, medtem ko so nekatere razvite za uporabo z določeno znamko ali linijo naprav.