Obstaja veliko različnih vrst preprečevanja malarije. Čeprav je bil kinin že sto let standardni preventivni ukrep, so v zadnjih pol stoletja na trg prišla številna zlahka dostopna zdravila proti malariji. Čeprav imajo ta zdravila enak namen, imajo vsako drugačna navodila za uporabo in edinstvene neželene učinke. Ker vsa zdravila proti malariji nikoli niso 100-odstotno učinkovita, mora oseba, ki potuje v državo z malarijo, sprejeti določene zdravorazumske ukrepe, da se zaščiti.
Popotnik se mora poučiti o številnih oblikah preprečevanja malarije iz štirih razlogov. Prvi je, da imajo nekatera zdravila proti malariji škodljive interakcije z drugimi zdravili. Drugič, vsa zdravila imajo neželene učinke, ki lahko škodujejo posameznikom z nekaterimi že obstoječimi zdravstvenimi stanji, in tretjič, zdravilo lahko ščiti samo pred eno vrsto malarije. Nenazadnje bo posameznik morda želel izbrati zdravilo, ki ima manj skupnih odmerkov, tako da jemanje zdravila ne predstavlja neprijetnosti. Ob upoštevanju teh premislekov lahko posameznik izbere ustrezno obliko preprečevanja malarije.
Primaquine je najučinkovitejše zdravilo za preprečevanje malarije, ki jo povzroča P. vivax, ena od štirih glavnih vrst bolezni. Odmerek je dnevni in posameznik lahko počaka dva dni pred potovanjem, da začne jemati zdravilo. Po vrnitvi domov mora jemati zdravila še en teden. Slaba stran primaquina je, da je treba posameznika testirati na pomanjkanje glukoze-6-fosfataze, preden bo zdravnik predpisal zdravilo. Tisti, ki so imeli pozitiven test na pomanjkanje, in nosečnice ne morejo jemati zdravila.
Meflokin je oblika preprečevanja malarije, ki ščiti pred vsemi oblikami malarije. Varno za nosečnice, jemlje se tedensko in je zato primerno za dolga potovanja. Posameznik mora začeti jemati zdravila dva tedna pred potovanjem in ne prenehati šele štiri tedne po prihodu domov. Ker je malarija na nekaterih območjih sveta odporna na meflokin, je potrebno drugo zdravilo. Nazadnje, tisti z določenimi srčnimi in psihiatričnimi boleznimi ne morejo jemati meflokina.
Doksiciklin je najcenejša oblika preprečevanja malarije. Sekundarna prednost je, da lahko zdravilo prepreči druge okužbe. Je vsakodnevno zdravilo, in čeprav lahko posameznik počaka dva dni pred začetkom potovanja, je treba zdravilo jemati štiri tedne po vrnitvi domov. Nosečnice in otroci, mlajši od 8 let, ne morejo jemati doksiciklina.
Poleg posvetovanja z zdravnikom, ko se odloča za pravo zdravilo proti malariji, lahko posameznik sprejme zdravorazumske ukrepe, da se zaščiti pred malarijo. Ker malarijo prenašajo komarji, so dolgi rokavi in hlače ter velikodušna količina pršila proti hroščem dobra prva obrambna linija. Spanje pod mrežo proti komarjem bo poskrbelo za zaščito in zagotovilo boljši spanec. V kombinaciji bodo te oblike preprečevanja zmanjšale verjetnost okužbe z malarijo praktično na nič.