Obstajajo tri osnovne vrste čolnskih motorjev: izvenkrmni dvo- in štiritaktni, vgrajeni plinski in dizelski motorji. Različne vrste popravil motorja čolna so odvisne od vrste motorja, ki se popravlja. Razčlenitev motorja na podsisteme, kot so hlajenje, gorivo, ohišje menjalnika in motor, lahko pomaga pri obveščanju o potrebnih popravilih.
Hladilni sistemi so v bistvu črpalke, ki krožijo vodo ali hladilno tekočino skozi motor. Črpalke imajo rotorje in tesnila, ki jih je sčasoma treba zamenjati in popraviti. Nekateri rotorji so gumijasti, drugi pa bronasti, in vsak zahteva drugačno vrsto vzdrževanja. Tesnila se razlikujejo od tesnil z ustnicami do dvodelnih mehanskih tesnil, odvisno od tipa čolna motorja. Mehanska vrsta je bolj delovno intenzivna za zamenjavo.
Sistemi za gorivo pri različnih vrstah motorjev se razlikujejo od uplinjača do vbrizgavanja goriva, vendar imajo vsi filtre, tako primarne kot sekundarne, ki jih je treba občasno zamenjati in popraviti. Menjava filtra za gorivo je običajen postopek vzdrževanja ne glede na tip motorja. Uplinjače je treba občasno očistiti in nastaviti, vbrizgalnike goriva pa je treba občasno očistiti, testirati in zamenjati. Tudi črpalke za vbrizgavanje, ki se razlikujejo od injektorjev goriva, je treba preizkusiti in po potrebi zamenjati.
Ohišja menjalnika so pogost element popravil motorjev čolnov. Takšni primeri so precej različni po vrsti in velikosti, od le nekaj funtov do tisoč funtov vsak, vendar vsi zahtevajo vzdrževanje sklopke. Različne vrste sklopk bodo zahtevale različna popravila. Vsi potrebujejo občasno prilagoditev ali zamenjavo. Ohišja menjalnika vsebujejo tudi zobnike, potopljene v olje, zato je treba olje redno menjati. Če olja v ohišju menjalnika ne zamenjate, lahko pride do večjih popravil motorja čolna, ki bodo verjetno precej dragi.
Čolni motorji so motorji na batni pogon, ki zahtevajo redno menjavo olja in filtrov. Sam motor ima bate, obroče in ležaje, ki se vsi obrabijo in zahtevajo zamenjavo. Ko motor ne deluje pravilno, lahko opravite test kompresije, da ugotovite, ali je težava v obročkih, ventilih, batih ali glavi cilindra. Kompresijski testi se izvajajo za vse tipe motorjev. Preverjanje časa je še en postopek, ki se izvaja na vseh motorjih. Izvajanje kompresijskih preskusov in preverjanje časovne razporeditve sta postopka, ki mehanikom pomagata pri določanju, katera popravila motorja čolna so potrebna.