Peptidi so velike polipeptidne verige, sestavljene iz do 50 aminokislin, ki jih lahko razvrstimo po funkciji in tudi po sintezi. Nekatere pogoste vrste peptidov, razvrščenih po funkciji, vključujejo hormone, nevropeptide in alkaloide. Ko so peptidi razvrščeni po sintezi, so lahko ribosomski, neribosomski in peptonski. Sistem klasifikacije peptidov velja za nepopolno znanost, ker lahko en peptid pripada več skupinam hkrati in znanstveniki še naprej razpravljajo, kdaj je treba peptid razvrstiti kot protein ali beljakovino kot peptid. Številni znanstveniki se strinjajo, da se peptid ne prilagaja zlahka določenemu vzorcu, medtem ko se beljakovina po naravi bolj razlikuje od konformacije.
Hormoni, ena najpogostejših klasifikacij peptidov v človeškem telesu, so specifične molekule sporočil, ki se uporabljajo v celični komunikaciji. Hormoni so opredeljeni kot takšni, ker jih izločajo in sintetizirajo specializirane skupine celic, imenovane endokrine žleze. Po izločanju hormonski peptidi potujejo do ciljnih organov, kjer delujejo. Oblika hormona je specifično povezana z receptorji na celičnih membranah ustreznega ciljnega organa. Na primer, hormonska peptida glukagon in inzulin imata specifična receptorska mesta v jetrih, ki jima pomagajo nadzorovati raven sladkorja v krvi.
Nevropeptidi so zelo razširjeni v centralnem in perifernem živčnem sistemu telesa in imajo specifične zaviralne in ekscitatorne funkcije. Nevropeptidi delujejo na skoraj enak način kot nevrotransmiterji, kot sta serotonin in dopamin. Eden najbolj znanih razredov nevropeptidov so endorfini. Endorfini veljajo za endogena zdravila proti bolečinam v telesu, pogosto v primerjavi z zdravilom morfij.
Del funkcije endorfina vključuje inhibicijo drugega nevropeptida, snovi P, ki prenaša signale bolečine iz perifernega živčnega sistema do sprejemnikov v centralnem živčnem sistemu. Včasih lahko nevropeptidi delujejo tudi kot hormoni v določenih sistemih telesa.
Glede na klasifikacijo peptidov zaradi njihove sinteze je večina ribosomskega tipa; ta tip peptida se sintetizira, ko se prevede ribonukleinska kislina (mRNA) na celici. Med prevajanjem pride do kemičnega procesa, ko se ena karboksilna skupina na aminokislini poveže z drugo aminokislino, da ustvari začetek aminokislinske verige. Ribosomski peptidi so pogosto sestavljeni iz 30 do 40 aminokislin, povezanih skupaj. Neribosomski tip peptida se sintetizira, ko so prisotni encimski katalizatorji. Peptonski peptidi so redki in nastajajo med prebavnimi procesi v telesu.