V industrijo peptidov je vključenih več različnih vrst podjetij. Kratke verige aminokislin, imenovane peptidi, so ključni reagenti ali reaktanti v mnogih tehnologijah. Peptide, ki jih je mogoče zgraditi iz sestavljanja aminokislin ali izolacije kratkih delčkov beljakovin, proizvaja peptidno podjetje po zelo zahtevnih standardih.
Peptidno podjetje pogosto ponuja poseben nabor izdelkov in storitev. Laboratorij za sekvenciranje sprejme vzorce neznane beljakovine in eksperimentalno določi linearno razporeditev aminokislin, ki sestavljajo to beljakovino. Te storitve se lahko uporabljajo tudi kot zunanje preverjanje dela drugega podjetja.
Podjetja za sintezo peptidov po meri proizvajajo peptide po specifikacijah svojih strank. To dosežemo s previdnim dodajanjem ene aminokisline za drugo v določenem vrstnem redu. Ta podjetja kmalu postanejo strokovnjaki za pogoje, pod katerimi se aminokislinske enote dodajo na peptidni rep. Raziskovalna skupina lahko prihrani veliko truda pri sklepanju pogodbe o tem delu, namesto da bi poskušala ustvariti kemikalije v podjetju.
Druga vrsta peptidnih podjetij podpira industrijo z zagotavljanjem knjižnic podatkov. Katalogizirani podatki opisujejo fizikalno strukturo in kemijske lastnosti peptidov. Zagotavljajo tudi standardizirane teste čistosti in strukture beljakovin. Storitve knjižnice peptidov med drugimi raziskovalnimi dejavnostmi podpirajo presejanje zdravil, razvoj cepiv in študije funkcijskih struktur.
Dobavitelji peptidov zagotavljajo prečiščene aminokisline in številne izolirane peptide za raziskovalne in manjše proizvodne namene. Število velikih proizvajalcev peptidov se je povečalo, saj so se raziskave o uporabi peptidov kot zdravil nadaljevale. Peptidno podjetje, ki proizvaja peptide na industrijski osnovi v skladu s smernicami dobre proizvodne prakse, je znano kot objekt GMP. Certifikat GMP ne potrjuje neposredno proizvodov procesne linije; vendar so s certificiranjem postopkov, ki proizvajajo peptide, pričakovani rezultat boljši kakovosti.
Vse te vrste peptidnih podjetij se bodo zanašale na druge dobavitelje, ki zagotavljajo encimske reagente, prečiščena topila, kemikalije in analitično programsko opremo. Vsi reagenti morajo biti visoko prečiščeni, da ohranijo peptide in zagotovijo reakcijsko klimo, ki zmanjša stranske reakcije. Encimi, ki se uporabljajo pri delu s peptidi, so zelo reaktivni in z njimi je treba ravnati previdno. Visokokakovostni dobavitelji smol zagotavljajo smole, ki se uporabljajo kot reakcijska mesta ali za ločevanje in karakterizacijo peptidov. Programska oprema, specifična za industrijo, pomaga pri identifikaciji in analizi, ki se izvaja v podjetju za peptide.