Od več kot 450 vrst morskih psov na svetu jih Mednarodna zveza za varstvo narave (IUCN) šteje za ogroženih okoli 200. Ljudje komercialno izkoriščajo več kot 100 vrst morskih psov, kar dodatno prispeva k njihovemu ogrožanju. Dejansko so se nekatere populacije vrst morskih psov v zadnjih letih zmanjšale za več kot 90 %, deloma zaradi človekovih dejavnosti.
Prvih deset najbolj ogroženih morskih psov, od najmanj do najbolj ogroženih, je:
morski pes Borneo, Carcharhinus borneensis
beloplavutega morskega psa, Hemitriakis leucoperiptera
nemi morski pes Centrophorus harrissoni
morski pes bodalec, Isogomphodon oxyrhynchus
črtasti pes Mustelus fasciatus
angelski morski pes, Squatina squatina
novogvinejski rečni morski pes, Glyphis sp. nov. C
rečni morski pes Bizant, Glyphis sp. nov. A
morski pes Pondicherry, Carcharhinus hemiodon
morski pes Gagnes, Glyphis gangeticus
Ena glavnih groženj za ogrožene morske pse je prekomerni ribolov. Številni najbolj ogroženi morski psi so prelovljeni, vključno z beloplavutega morskega psa, morskega psa bodalca in rečnega morskega psa Bizant. Morski psi so komercialno povprašeni po svojih plavutih in hrustancu. V delih Azije juha iz plavuti morskega psa velja za poslastico, medtem ko mnogi verjamejo, da ima hrustanec morskega psa koristi za zdravje, vključno z bojem proti raku, zdravljenjem artritisa in krepitvijo imunosti. Te trditve trenutno niso podprte z močnimi znanstvenimi dokazi, vendar lahko mnogi morski psi umirajo zaman.
Drug dejavnik, ki ogroža številne ogrožene morske pse, vključno z beloplavutim morskim psom in rečnim morskim psom Bizant, je uničenje habitatov. Mangrove so podvodna obalna območja, ki jih številne vrste morskih psov običajno uporabljajo kot gnezdišča. So območja vegetacije vzdolž obale in jih lahko obravnavamo kot podvodne gozdove. V mnogih delih sveta ljudje uničujejo mangrove, da bi naredili prostor za ribogojstvo ali gojenje vodnih vrst. Posledično se številni morski psi nimajo preveč razmnoževati in dejstvo, da imajo na začetku nizko stopnjo razmnoževanja, samo še poslabša težavo.
Morske pse ubijajo veliko hitreje, kot se lahko razmnožijo. Na splošno morski psi potrebujejo več let, da dosežejo spolno zrelost in običajno rodijo nekaj potomcev naenkrat. Če jih bodo še naprej zaklali s sedanjo hitrostjo, se pričakuje, da bodo nekatere vrste izumrle v naslednjem desetletju. Na primer, populacija neumnega morskega psa se je v zadnjih desetletjih zmanjšala za 99 %, in možno je, da obstaja manj kot 250 posameznikov v vrstah morskih psov Nove Gvineje in Bizant. Od leta 2010 so naravovarstveniki in zagovorniki morskih psov dejali, da je treba sprejeti kritične in takojšnje ukrepe v imenu ogroženih morskih psov, da se zagotovi njihovo preživetje.