Obstajajo tri osnovne vrste kirurgije lipoma, ko je potreben kirurški poseg, in so sestavljeni iz liposukcije, enukleacije in ekscizije. Liposukcija je vrsta lepotne kirurgije, s katero lahko odstranimo nekatere izrastke, čeprav s tovrstnim posegom morda ne bo mogoče odstraniti celotne rasti. V nekaterih primerih se lahko uporabi enukleacija za odstranitev zelo majhnih lipomov z minimalnimi brazgotinami. Ekscizija je najpogosteje uporabljena vrsta operacije lipoma in vključuje odstranitev celotnega tumorja. O vseh vprašanjih ali pomislekih glede najboljše vrste operacije lipoma v posamezni situaciji se je treba pogovoriti z zdravnikom ali drugim zdravstvenim delavcem.
Liposukcija je lahko uporabna oblika kirurgije lipoma v nekaterih primerih, kjer so ti tumorji prisotni. Ta način zdravljenja je še posebej pomemben, kadar se prizadeto območje nahaja na delu telesa, kjer se je treba izogibati velikim brazgotinam. Lokalni anestetik, kot je razredčen lidokain, na splošno zagotavlja ustrezen nadzor bolečine za to vrsto pisarniškega postopka.
Enukleacija je vrsta operacije lipoma, ki se lahko uporablja za odstranitev zelo majhnih lipomov. Za ta postopek se naredi zelo majhen rez tik nad tumorjem. Majhno kirurško orodje, znano kot kireta, se vstavi v zarezo in se nežno premika, tako da je tumor previdno ločen od vseh okoliških tkiv. Šivi običajno niso potrebni pri tej vrsti minimalno invazivne kirurgije lipoma, na kirurško rano pa se običajno položi posebna vrsta tlačne gaze, ki pomaga preprečiti nastanek krvnih strdkov.
Najpogostejša vrsta operacije lipoma je operacija ekscizije. Za omrtvičenje prizadetega območja se običajno uporablja lokalni anestetik, čeprav se lahko občasno uporabi splošna anestezija, odvisno od velikosti in lokacije tumorja ter splošnega zdravstvenega stanja bolnika. Vrsta kirurškega noža, znanega kot skalpel, se nato uporablja za rez skozi kožo in vse okoliško maščobno tkivo. To velja za nekoliko občutljivo operacijo, saj je za kirurga pomembno, da se izogne nenamernemu zarezu v katerega od okoliških živcev ali krvnih žil.
Zapleti po operaciji lipoma so redki, čeprav je treba vse težave obvestiti zdravnika za nadaljnjo zdravniško oceno. Okužbe kože so med najpogosteje prijavljenimi zapleti in jih je običajno mogoče zdraviti z antibiotiki na recept, če jih odkrijemo zgodaj. Redko se lahko med posegom poškodujejo mišice ali živci, včasih pa so za popravilo poškodbe potrebne dodatne operacije.