Operacija ileostomije vključuje preusmeritev dela črevesja, tako da se odpre v vrečko. Ta vrsta operacije se uporablja, ko se del črevesja odstrani zaradi posledic raka ali drugih bolezni, ki poškodujejo črevesje. Obstajajo različne vrste kirurgije ileostomije in postopek je lahko začasen, kot pri ileostomiji z zanko, ali stalen. Vrečka je lahko umetna, ki se nosi zunaj telesa, kot pri končni ileostomi, ali pa je zgrajena iz črevesja in se nahaja znotraj telesa, kot pri celinski ileostomi ali ileo-analni vrečki.
Pri stanjih, kot sta ulcerozni kolitis in Crohnova bolezen, imunski sistem napade črevesje, kar povzroči vnetje, drisko in bolečino. Ko zdravila ne delujejo, bo morda potrebna ileostomija, da se zaobide poškodovano črevesje, tako da prebavljena hrana preide naravnost v vrečko. Običajno se pri bolnikih z vnetnimi črevesnimi boleznimi uporablja vrsta operacije ileostomije, znane kot končna ileostomija. Pri končni ileostomiji črevo preide skozi luknjo v koži trebuha in se odpre v sintetično vrečko, ki se nosi zunaj telesa. To je prednostno kot metode, pri katerih se notranja vrečka ustvari iz drugega dela črevesja, saj obstaja nevarnost, da bi vnetno črevesno stanje pravočasno prizadela tudi vrečko.
Ko ima oseba raka na črevesju, to včasih pomeni, da je treba odstraniti del črevesja. Ko si preostala črevesja opomorejo, se lahko črevesje ponovno poveže skupaj. Uporabi se lahko vrsta začasne ileostomske operacije, znane kot ileostomija z zanko, pri kateri je del črevesja povezan z luknjo ali stomo na površini trebuha. To omogoča, da iztrebki preidejo v vrečko, medtem ko se preostalo črevo pusti zaceliti. Operacija preobrata ileostome omogoča, da se stoma zapre in črevesje ponovno poveže.
Ileo-analna vrečka je vrsta kirurške tehnike ileostomije, pri kateri se vrečka, narejena iz črevesja, poveže z mišicami okoli anusa. Uporablja se, ko so bili odstranjeni končni deli črevesja, debelo črevo in danka, in omogoča relativno normalno odvajanje blata. Če ileo-analne vrečke ni mogoče ustvariti, bi lahko namesto tega uporabili celinsko ileostomo. Pri celinski ileostomiji se iz črevesnega tkiva oblikuje vrečka, ki se nahaja znotraj trebuha. Ker ga ni mogoče izprazniti kot zunanjo vrečko, se v koži ustvari ventil, skozi katerega se lahko vstavi cev za odvajanje vsebine.