Sredstva za neprofitne organizacije lahko prihajajo iz mnogih krajev. Donacije in pogodbe pogosto zagotavljajo velik del sredstev organizacije. Provizije za stranke in komercialni podvigi omogočajo organizacijam, da zaslužijo tudi sredstva za programe.
Podpora fundacije in vlade pogosto zagotavljajo pomemben del financiranja neprofitnih organizacij. Agencije pogosto pripravijo predloge za nepovratna sredstva, ko izvajajo nov program, da zaprosijo za finančno pomoč vlade ali fundacije. Če bo organizacija prejela nepovratna sredstva, bo prejela znesek denarja, ki ga bo porabil za posebne namene na podlagi predloga in določil vir financiranja. Podaljšanje nepovratnih sredstev je lahko na voljo, ko so začetna sredstva porabljena.
Pogodbe, zlasti vladne, so pogost vir financiranja neprofitnih organizacij. Če neprofitna agencija nudi storitev, ki bi lahko bila koristna drugim organizacijam, na primer prevoz za invalide, lahko agencija prejme pogodbo od vlade ali druge organizacije za zagotavljanje storitve. Pogodba na splošno določa trajanje in postopek plačila. Priljubljene vrste pogodb vključujejo pogodbe o povračilu stroškov, uspešnosti in upravljani oskrbi, uporabljena vrsta pa določa izračun plačil.
V nasprotju s splošnim prepričanjem lahko neprofitna organizacija ustvarja dobiček, dokler sredstva porabi za zagotavljanje storitev za svoje stranke. Zaračunavanje stroškov strankam za opravljene storitve je lahko glavni vir financiranja za neprofitno organizacijo. Ni nenavadno, da pristojbine strank pokrijejo delne ali celotne stroške programa. V nekaterih primerih bi lahko honorarji, zbrani iz priljubljenega programa, zagotovili dovolj sredstev za kritje stroškov drugih programov, ki jih vodi organizacija.
Poleg provizij strank komercialna podjetja včasih zagotavljajo financiranje neprofitnih organizacij. Nekatere dobrodelne organizacije prodajajo blago, da zaslužijo denar za svoje programe. Na primer, skupnost upokojencev lahko prodaja obrt, ki so jo ustvarili prebivalci. Da bi se izognili izgubi svojega neprofitnega statusa, oproščene davka, se mora komercialni podvig neposredno nanašati na poslanstvo organizacije in podjetje ne sme postati preveliko. Izložki spletnih trgovin so priljubljena prodajna mesta za komercialne podvige neprofitnih organizacij, ker njihova implementacija ali vzdrževanje stanejo malo.
Dobrodelni opomniki in programi zapuščine zagotavljajo tudi dolgoročno financiranje neprofitnih organizacij. V dobrodelnih skladih za opomnike donatorji zagotovijo delnice, obveznice ali denar organizaciji, pri čemer prejmejo oprostitev davka in zajamčeni dohodek za življenje. Po smrti donatorja organizacija prejme preostanek zaupanja. Podobno programi zapuščine omogočajo ljudem, da del svojega premoženja prepustijo organizaciji. Donatorji v bistvu vključijo organizacijo v svoje oporoke in organizacija prejme donacijo, ko donator umre.