Obstaja široka paleta vrst boj, ki izpolnjujejo potrebe, ki segajo od osnovne navigacije do zbiranja znanstvenih podatkov. V vseh primerih je običajno protizakonito premikanje boje ali privez nanjo, razen če je boja privezna boja, zasnovana posebej za ta namen. Pomorščaki poročajo tudi o bojah, ki so zašle ali se odvezale zaradi vljudnosti drugim čolnarjem in zaradi zagotavljanja varnosti plovbe.
Morske oznake so navigacijske boje. Pod to rubriko spadajo številne vrste boj, vključno z bojami za pločevinke in nun, ki se uporabljajo za označevanje desne in leve strani navigacijskega kanala. Boje za pločevinke so zelene in označujejo desno stran kanala in bodo označene z lihimi številkami. Nun boje so rdeče in označujejo levo stran kanala, označene pa so s sodimi številkami. Poleg teh osnovnih navigacijskih boj je mogoče najti tudi varne vodne oznake, ki označujejo, da je prehod čist, ter posebne namenske boje, ki so rumene in imajo običajno opozorilne informacije. Pri navigaciji se uporabljajo tudi druge vrste boj: prednostne oznake kanala so rdeče ali zelene na vrhu, kar označuje, katera stran kanala ima prednost, oznake razdalje pa uporabljajo ladje za orientacijo.
Obstajajo tudi številne vrste boj, ki so zasnovane za znanstvene namene. Sonobne boje na primer zbirajo akustične podatke, kar pomeni, da jih je mogoče uporabiti tudi v boju proti podmornicam. Vremenske boje zbirajo podatke o temperaturah, vetru, nabrekanju in tako naprej za napovedovanje, boje za cunami pa posebej pazijo na razmere, ki bi lahko kazale na prihajajoči cunami ali hudo neurje.
Boje se uporabljajo tudi za označevanje navigacijskih nevarnosti, kot so plitvine in skale, v tem primeru imajo lahko luči, zvonce ali rogove, da zagotovijo, da se mornarji zavedajo njih v slabem vremenu. Posebne boje za označevanje se lahko uporabljajo tudi za označevanje nevarnosti, kot so potopljene ladje. Na območjih z veliko morskega ledu se lahko uporabljajo oznake za označevanje čistega kanala skozi led; ti označevalci tudi opozarjajo ljudi na površini ledu na luknje v ledu, ki bi lahko bile zanje nevarne.
Potapljači zaradi varnosti uporabljajo več vrst boj. Ko so potapljači pod vodo, plujejo z bojo s klasično potapljaško zastavo, rdečim poljem z belo črto, takšno zastavo pa lahko izobesimo tudi s čolna s potapljači. Potapljači lahko uporabijo tudi druge zastave boje, da označijo, da jih lahko ustavijo zaradi dekompresije, s čimer opozarjajo ladje na dejstvo, da so ljudje pod vodo, in naj ostanejo prosto.
Vojske uporabljajo tudi več vrst boj. Boje se lahko uporabljajo za prepoznavanje minskih polj, na primer, skupaj z morebitnimi nevarnostmi, kot je območje, kjer poteka vojaška vaja. Boje se uporabljajo tudi v podmorniškem bojevanju, za sledenje podmornicam in prenos podatkov ter za označevanje teritorialnih voda. Morda boste videli tudi specializirane boje, ki jih uporabljajo ribiči za prepoznavanje stvari, kot so pasti za jastoge in podvodne mreže.