Obstaja nešteto vrst bakterij, od katerih so nekatere patogene, nekatere pa so bistvenega pomena za življenje. Patogeni povzročajo bolezni pri ljudeh ali rastlinskem življenju. Nekatere vrste bakterij te vrste vključujejo H. pylory, ki povzroča bolezni prebavil, in streptokok, ki povzroča strep grlo. Koristne bakterije, ki uspevajo v človeškem črevesnem traktu in spodbujajo dobro zdravje, so znane kot vrsta probiotika, imenovana acidofil ali laktobacil. Aerobne bakterije potrebujejo kisik za preživetje, medtem ko anaerobne bakterije ne prenašajo kisika in na splošno uspevajo pod vodo.
Bakterije so mikrobi ali enocelični organizmi, vrste bakterij pa se lahko razlikujejo. Te bakterijske mikrobe je mogoče videti le z uporabo zmogljivega mikroskopa. Glede na strukturo bakterij in vrsto jih bomo videli v različnih oblikah. Bacili so ime za katero koli bakterijo, ki ima paličasto obliko. Spirilla je ime za sorto v obliki spirale, koki pa je ime za kroglaste bakterije.
Staphylococcus Aureus je vrsta bakterij, ki je lahko zelo nevarna za zdravje ljudi. Povzroča zastrupitev s hrano, ko je hrana kontaminirana s to bakterijo. Mlečni izdelki in meso so še posebej nagnjeni k kontaminaciji. Ta vrsta bakterij lahko povzroči tudi okužbe s stafilokokom. Bakterije vstopijo v kožo skozi odprto rano in lahko povzročijo kožne okužbe, ki zahtevajo zdravljenje.
Patogene vrste bakterij, znane kot Clostridium botulinum, lahko povzročijo resne bolezni, kot je botulizem, ki se prenaša s hrano. Med je eno živilo, za katerega je znano, da nosi spore klostridija. Pri zdravih odraslih so te spore na splošno neškodljive. Pri tistih z oslabljenim imunskim sistemom ali otrocih, mlajših od enega leta, pa je uživanje medu lahko tvegano.
Escherichia coli, splošno znana kot e.Coli, je bakterijska vrsta, ki povzroča izjemno resne zastrupitve s hrano. V nekaterih primerih je ta sev lahko usoden, če se pravočasno ne zagotovi ustrezno zdravljenje. Obstaja na desetine sevov te bakterije, od katerih je večina običajno netoksičnih. Več sevov lahko povzroči hude okužbe prebavil.
Bakterijska vrsta, znana kot legionella pneumophila, lahko povzroči resne okužbe pljuč. Ena najbolj znanih okužb, ki jih lahko povzroči ta sev bakterij, se imenuje legionarska bolezen. Ena od oblik te bolezni povzroča pljučnico. Ta bakterija uspeva v vroči vodi in toplem okolju.
Obstaja nešteto vrst bakterij, od katerih ima vsaka svojo bakterijsko strukturo in namen. Identifikacije vsake vrste ne bi bilo mogoče zamisliti. Vedno se pojavljajo različne podvrste bakterij.