Na voljo so alternativna zdravila za zdravljenje ščitnice za hipotiroidizem ali premajhno delovanje ščitnice in manj pogost hipertiroidizem ali prekomerno delovanje ščitnice. Bolezni ščitnice se pogosto zdravijo z vitaminsko in prehransko terapijo v kombinaciji s spremembo prehrane. Kiropraktika, akupunktura in zeliščarstvo so nekatere druge vrste alternativne medicine za ščitnico. Tradicionalna kitajska medicina je še en pristop, ki je bil učinkovit za nekatere, ki trpijo zaradi težav s ščitnico.
Ko živci, ki so odgovorni za tvorbo ščitničnih hormonov tiroksina in trijodotironina, ne delujejo pravilno, je možno, da pride do motenj ščitnice. Ti hormoni nadzorujejo hitrost presnove. Kiropraktične prilagoditve lahko zmanjšajo pritisk na stisnjene živce, ki lahko povzročijo neaktivno ščitnico. Zmanjšanje pritiska na te živce lahko izboljša njihovo sposobnost prenosa električnih signalov, povečana živčna funkcija pa lahko spodbudi ščitnico, da proizvaja zdrave ravni ščitničnega hormona.
Študije so pokazale, da lahko akupunktura zmanjša simptome hipotiroidizma. Verjame se, da vstavljanje igel v akupunkturne točke na telesu poveča proizvodnjo ščitničnih hormonov. Tudi če se proizvodnja hormonov ne poveča, je akupunktura ena od metod alternativne medicine ščitnice, ki lahko zmanjša simptome hipotiroidizma. Ti simptomi vključujejo zaspanost, depresijo in zaprtje.
Včasih lahko dodajanje ali izločanje nekaterih živil zmanjša simptome težav s ščitnico. Dodajanje živil, bogatih z beljakovinami, magnezijem in kalcijem v prehrano, lahko spodbuja zdravo delovanje ščitnice. Kelp, vrsta morskih alg, znana po visoki vsebnosti joda, je odlično prehransko dopolnilo za ljudi, ki trpijo za hipotiroidizmom. Znano je tudi, da kokosovo olje izboljša delovanje ščitnice.
Jod je ključnega pomena za zdravo ščitnico, saj je jod potreben za proizvodnjo hormonov. Odprava živil, ki blokirajo absorpcijo joda, je pristop, ki lahko izboljša delovanje ščitnice. Nekatera od teh živil so soja, arašidi in zelenjava iz križnic, kot so brstični ohrovt, zelje in cvetača. Vendar teh živil ni treba popolnoma izločiti iz prehrane. Kuhanje vsaj sedem minut je dovolj, da sestavine, ki blokirajo jod, v teh živilih postanejo neaktivne.
Različna zelišča so v preteklosti pomagala pri težavah s ščitnico. Zeliščarji, ki sledijo zahodni zeliščni tradiciji, pogosto priporočajo ingver, palmeto in sladki koren. Po drugi strani pa izvajalci tradicionalne kitajske medicine pogosteje predpisujejo astragalus, cimet in ginseng. Disfunkcija ščitnice je lahko izjemno resna, zato se mora oseba, ki sumi na težave s ščitnico, vedno posvetovati z zdravnikom, preden se loti alternativnega zdravljenja ščitnice.