Obstajajo štiri glavne vrste neonatalne mehanske ventilacije. Najpogosteje se uporabljajo trije od njih – tradicionalno prezračevanje, visokofrekvenčno oscilatorno prezračevanje in visokofrekvenčno prezračevanje s curkom. Četrti tip, neprekinjen pozitivni tlak v dihalnih poteh (CPAP), je najmanj invaziven način prezračevanja novorojenčka, vendar ni tako priljubljen, kot je bil pred pojavom oscilatornega in zračnega prezračevanja.
Tradicionalna neonatalna mehanska ventilacija zahteva, da ima novorojenček endotrahealno cev v dihalno pot. Cev je pritrjena od te dihalne poti do ventilatorja. Zdravnik odredi količino tlaka, kisika in hitrosti dihanja, ki jih želi, da bi novorojenček zagotovil z mehansko ventilacijo.
Oscilatorno neonatalno mehansko prezračevanje je mogoče nastaviti na zelo visoke frekvence prezračevanja, ki segajo od 210 do 900 vdihov na minuto. Ta vrsta prezračevanja omogoča, da je tlak v pljučih bolj konstanten pri vdihu in izdihu. Uporablja komplet cevi za endotrahealno cev, kot je tradicionalno prezračevanje, vendar je učinkovitejši za zelo mlade novorojenčke, ki ne morejo vzdrževati zadostne ravni kisika na tradicionalnih ventilatorjih.
Jet neonatalna mehanska ventilacija je podobna oscilatorni obliki, saj daje tudi višjo frekvenco dihanja skozi isto vrsto cevi. Razlika je v tem, da nadzoruje dovajanje kisika novorojenčku s palico ali kroglico v napravi. To omogoča, da majhni, kratki impulzi zraka vstopijo v pljuča v nasprotju z bolj konstantnim pretokom zraka.
Tradicionalno mehansko prezračevanje novorojenčkov ima relativno omejeno uporabo. Njen tipični bolnik je zdrav novorojenček, ki bo morda potreboval zelo kratek čas na ventilatorju in ima dokaj normalno pljučno tkivo. Ta vrsta prezračevanja se uporablja le nekaj ur do nekaj dni; ni za novorojenčke, ki potrebujejo dolgotrajno prezračevanje.
Oscilatorno in brizgalno neonatalno mehansko prezračevanje se lahko uporablja tudi le nekaj dni. Vendar pa se bodo uporabljali pri novorojenčkih, ki imajo morda nezrela pljuča ali pljučno bolezen, povezano s prezgodnjim porodom. Pogostost tovrstnih ventilatorjev preprečuje dolgotrajne poškodbe nezrelega tkiva in preprečuje dolgotrajne stranske učinke mehanskega prezračevanja.
CPAP je zunanji način za zagotavljanje neprekinjenega pozitivnega tlaka v dihalnih poteh pri novorojenčku brez vstavljanja endotrahealne cevi v dihalne poti. CPAP uporablja masko, nameščeno na nosu novorojenčka, ali niz rogljev, nameščenih v nosne poti. Cev je pritrjena tudi na stroj in vlažilec zraka. Aparat nato zagotovi, da se z vsakim spontanim vdihom dojenčka v pljuča dostavi določena količina pritiska.
Mehansko prezračevanje novorojenčkov se lahko izvaja za kratek čas ali od nekaj dni do tednov, če je potrebno. Vrsta neonatalne mehanske ventilacije, ki jo izbere zdravnik, je odvisna od starosti in velikosti novorojenčka. Odvisno je tudi od stanja neonatalnega pljučnega tkiva in splošnega cilja zdravljenja z neonatalnim mehanskim ventilatorjem.