Obstaja na stotine različnih metod za določanje koncentracije beljakovin. Neverjetna raznolikost vrst beljakovinskih raztopin, ki jih analizirajo biokemiki, je razlog, zakaj ni ene same univerzalne metode, ki bi delovala za vse vrste beljakovinskih raztopin. Najpogostejši proteinski testi so Bradfordov test, Lowryjev test in test bicinhoninske kisline. Kljub temu je bilo po potrebi razvitih nešteto variacij, da bi se izognili morebitnim kemičnim nezdružljivostim med raztopino beljakovin in reagenti, ki se uporabljajo v testu.
Na splošno obstajata dve glavni kategoriji testov za določanje koncentracije beljakovin. V prvi skupini metod se beljakovinski raztopini doda pisano ali fluorescentno barvilo, ki se specifično veže na beljakovine. Vezano barvilo ima edinstveno absorpcijsko valovno dolžino, ki je sorazmerna s količino beljakovin. S pomočjo spektrometra je mogoče oceniti koncentracijo beljakovin.
Druga skupina testov vključuje dodajanje ionov bakra(II) v raztopino beljakovin, kjer se ti ioni reducirajo v ione bakra(I). Ti reducirani ioni lahko nato tvorijo barvite komplekse z vezavo na beljakovine. Z merjenjem absorbance pri njihovih edinstvenih valovnih dolžinah je mogoče sklepati tudi na koncentracije beljakovin.
Ena izmed najbolj priljubljenih metod za določanje koncentracije beljakovin je Bradfordova analiza. V tem testu dodamo rdeče barvilo, imenovano coomassie brilliant blue, k raztopini beljakovin v kislih pogojih. Ker se to barvilo veže na beljakovine, tvori trajni modri kompleks z značilno absorbanco pri 595 nanometrov.
Kljub splošni vsestranskosti Bradfordovega testa je nezdružljiv z nekaterimi beljakovinskimi raztopinami. Zlasti Bradfordov test moti prisotnost natrijevega dodecil sulfata (SDS), detergenta, ki se običajno uporablja za čiščenje beljakovin in razgradnjo celic z lizo. Ta detergent moti vezavo barvila na beljakovine, kar ima za posledico nezanesljivo in netočno odčitavanje absorpcije. Če je prisoten varnostni list, je torej treba uporabiti druge vrste metod.
Razvita je bila še ena serija beljakovinskih testov in vsi vključujejo različico biuretovega testa. V tej reakciji se protein združi z vodno bazo in bakrovimi (II) ioni. Ti ioni se reducirajo in nato kelirajo z beljakovinami, da tvorijo barvite komplekse. Dva testa, ki uporabljata ta test, sta Lowryjev test in test bicinhoninske kisline.
Z Lowryjevim testom se biuretovemu testu doda Folin-Ciocalteu reagent. Folin-Ciocalteu reagent oksidira aromatične ostanke, zlasti triptofan, in pomaga kompleksu, da se močno absorbira pri 750 nanometrov. Po drugi strani test bicinhoninske kisline vključuje dodajanje bicinhoninske kisline v biuretov test. Po kratki inkubaciji pri približno 104° Fahrenheita (40° Celzija) dva ekvivalenta kisline in peptidne vezi proteina kelirata en sam bakrov(I) ion. Rezultat je kompleks, ki močno absorbira pri 562 nanometrih.
Pri izbiri metode za določanje koncentracije beljakovin je pomembno, da upoštevamo različne kemične funkcionalne skupine, ki so prisotne v raztopini. Prisotnost določenih stranskih verig aminokislin, disulfidnih vezi in kofaktorjev lahko povzroči, da je določitev koncentracije beljakovin zelo netočna. Pogosto je treba upoštevati ne le beljakovine, ampak tudi druge reagente in pufre, kot so redukcijska sredstva in detergenti. Idealna metoda bo kemično združljiva, pa tudi zanesljiva, poceni in enostavna za nastavitev.