Različne bolezni lahko prizadenejo rastline malin, vključno z različnimi vrstami plesni, trsnim botritisom, antraknozo, zvijanjem listov, mozaično boleznijo in klorozo žil. Nekatere od teh bolezni malin povzročajo invazivne glive, druge pa so virusne narave. Strokovnjaki priporočajo nakup rastlin, ki so certificirane brez virusov, zaradi posebne dovzetnosti rastline maline za virusne bolezni.
Številne bolezni malin izvirajo iz prisotnosti gliv, ki negativno vplivajo na določena območja rastline. V primeru trsnega ožiga gliva vstopi na mesto rane na veji, ki bi jo lahko povzročile poškodbe žuželk, obrezovanje ali poškodbe med presajanjem. To bolezen najpogosteje opazimo pri črnih malinah. Cane botrytis prizadene najstarejše liste rastline z rjavimi lisami ali sivkami progami. V naprednejših fazah bo rastlina razvila temne rane, podobne mehurjem. Antraknoza povzroča vijolične ali rdeče lise na listih, vejah, steblih ali plodovih rastline maline.
Ostrosti ožig, ki prizadene veje in liste rastline maline, se običajno začne kot okužba na robovih listov, ki se širi navznoter. To stanje je pogostejše pri rdečih malinah in lahko prepreči cvetenje popkov. Ožig mušic ima dvojni vzrok, saj je glivi, ki povzroča bolezen, dovoljen vstop v rastlino prek poškodovanega tkiva, ki ga povzročajo ličinke mušic. Je ena od bolezni malin, ki lahko povzroči strukturne poškodbe rastline. O pegavosti listov pričajo črnozelene lise ali luknje na listih rastline, stanje, ki ga lahko zmanjšamo z ustreznim obrezovanjem ali uporabo fungicida.
Nekatere bolezni malin povzroča virus. Zvijanje listov se kaže kot zvijanje in beljenje vej in listov maline, pri čemer so vsi plodovi izredno semeni in suhi. To stanje se pogosto pojavi zaradi okužbe z zaplatami divje maline. Mozaična bolezen je med številnimi boleznimi malin, ki prizadenejo plodove in liste ter zmanjšajo celotno velikost rastline. Kloroza žil vodi do posvetlitve in izkrivljanja listov maline, pa tudi do splošnega skrajšanja rastline.
Da bi se izognili ali obvladovali bolezni malin glivičnega izvora, strokovnjaki priporočajo vzdrževanje rastlin z obilico kroženja zraka z ustreznim pleveljem in obrezovanjem. Za rastline, ki jih zalivamo z namakalnim sistemom, lahko izogibanje dolgotrajnim obdobjem prekomerne vlage pomaga zmanjšati invazijo gliv. Fungicidi lahko pomagajo pri obvladovanju glivičnih bolezni, ko se pojavijo. Stanje, kot je glivica, je učinkoviteje obravnavano z insekticidom.