Obstaja veliko alternativnih načinov zdravljenja avtizma. Na primer, starši avtističnih otrok v ta namen pogosto poskušajo spremeniti prehrano, nekateri pa kot zdravljenje razmišljajo o načinih za odstranjevanje toksinov iz telesa. Poleg tega lahko alternativne terapije za avtizem vključujejo tiste, ki vključujejo ustvarjalnost, vključno z vizualno umetnostjo in glasbo. Ker alternativne terapije morda ne delujejo vedno po pričakovanjih, bo ljudem morda koristilo, da se pred njihovo uporabo pogovorijo z zdravnikom.
Starš avtistične osebe se lahko odloči, da svojemu otroku prepreči uživanje hrane, ki običajno povzroča simptome alergije, kot so mlečni izdelki in pšenica, tudi če ni dokazov, da je otrok alergičen nanje. Nekateri starši odstranijo tudi kvas in beljakovine, imenovane gluten in kazein, iz prehrane svojih otrok, da bi jim pomagali. Vitaminski dodatki, kot sta vitamin B-6 in B-12, so pogosto vključeni tudi v alternativno zdravljenje avtizma. Običajno staršem svetujemo, da se pred dramatičnimi spremembami otrokove prehrane posvetujejo z dietetikom, saj lahko resne omejitve povzročijo prehranske pomanjkljivosti.
Nekateri verjamejo, da je razvoj avtizma lahko povezan s kopičenjem strupenih kovin. Kot taka nekatera alternativna zdravljenja avtizma vključujejo poskuse, da bi jih izvlekli iz telesa prizadete osebe. Dve od kovin, ki sta pogosto vpleteni v avtizem, sta živo srebro in svinec, starši pa lahko poiščejo kelacijsko terapijo za svoje otroke, da bi izvlekli te in druge sumljive kovine. Kelacijska terapija vključuje injiciranje kemikalije v telo prizadete osebe v upanju, da se bo ta pritrdila na škodljive kovine in pomagala pri njihovi odstranitvi iz telesa. Bolnik lahko prejema injekcije več tednov v upanju, da bo ozdravil avtizem, vendar terapija odstrani tudi minerale, ki jih bolnik potrebuje, in lahko povzroči zdravstvene težave.
Alternativno zdravljenje avtizma lahko vključuje tudi terapije, ki temeljijo na uporabi umetnosti in ustvarjalnosti. Na primer, umetniška terapija, ki jo izvaja izkušen, pooblaščeni terapevt, naj bi pripomogla k izboljšanju komunikacijskih veščin in sposobnosti avtistične osebe, da uporablja svojo domišljijo. Prav tako mu lahko pomaga bolje razlagati izraze obraza drugih ljudi, kar lahko pomaga pri komunikaciji. Poleg tega lahko umetniška terapija pomaga ljudem z avtizmom premagati težave z dotikom določenih vrst materialov, vključno s tistimi, ki so mokri.
Glasbena terapija lahko pomaga tudi avtističnemu posamezniku razviti komunikacijske sposobnosti in se celo naučiti izražati se na neverbalne načine. Osebi z avtizmom bi lahko koristila tudi glasbena terapija, ki vključuje igre, saj ga njegovo sodelovanje spodbuja k interakciji z drugimi. Poleg tega mnogi strokovnjaki trdijo, da lahko glasba pomaga pri razvoju možganov in družbenem razvoju ter pomaga pri izgradnji in izboljšanju vitalnih motoričnih sposobnosti. Alternativni načini zdravljenja avtizma, ki temeljijo na ustvarjalnosti, lahko pomagajo tudi avtistični osebi, da se bolje spopade z zvoki in spremembami v svojem okolju, ki bi se sicer lahko izkazale za moteče zanj.