Težave pri operaciji žolčnika se včasih pojavijo po odstranitvi tega majhnega organa. Nekateri od teh zapletov lahko postanejo očitni takoj po posegu ali pa šele nekaj dni ali tednov po operaciji. Najpogostejše težave pri operaciji žolčnika vključujejo negativne reakcije na anestezijo, poškodbe črevesja in poškodbe žolčevodov. Pankreatitis, zgrešeni žolčni kamni in razvoj kronične driske so tudi možni zapleti po operaciji žolčnika. O vseh vprašanjih ali pomislekih glede težav pri operaciji žolčnika na individualni osnovi se je treba pogovoriti z zdravnikom ali drugim zdravstvenim delavcem.
Nekateri ljudje lahko doživijo negativne reakcije na anestezijo, ki se uporablja, ko odstranimo žolčnik. Te težave običajno povzročijo hudo slabost ali bruhanje, čeprav so možne resnejše reakcije. Nekateri bolniki lahko razvijejo hudo alergijsko reakcijo na zdravila za anestezijo, ki včasih povzroči težave z dihanjem, v redkih primerih pa lahko pride do smrti. Tudi zaradi operacije se lahko občasno tvorijo krvni strdki. Če se ti krvni strdki premaknejo v srce ali pljuča, lahko pride do zapletov s smrtnim izidom.
Poškodba žolčevoda ali črevesja je še ena možna težava pri operaciji žolčnika. Če je žolčevod poškodovan med operacijo, lahko žolč uhaja v telo, kar sčasoma v mnogih primerih povzroči poškodbe jeter. Črevesje in žolčnik se nahajata zelo blizu drug drugemu, kar omogoča kirurgu, da med operacijo nenamerno poškoduje črevesje. Večino poškodb žolčevodov ali črevesja opazimo in popravimo takoj, čeprav majhne solze lahko ostanejo neopažene, razen če se začnejo razvijati resni zdravstveni zapleti.
Redko kirurg med posegom zamudi enega ali več žolčnih kamnov, zaradi česar ti kamni ostanejo v trebušni votlini. Te težave pri operaciji žolčnika lahko povzročijo resne zaplete, kot so obstrukcije ali abscesi. Ta vrsta zapleta skoraj vedno zahteva eno ali več dodatnih operacij.
Kronična slabost ali driska sta pogosti težavi pri operaciji žolčnika in ju ima veliko ljudi, ki so bili podvrženi temu posegu. Izogibanje mastni ali mastni hrani lahko pomaga preprečiti, da bi te težave postale resne. Nekateri ljudje bodo razvili povečano občutljivost tudi za druga živila, čeprav se natančna živila lahko razlikujejo od osebe do osebe. Ko se odkrijejo sprožilci hrane, jih lahko omejimo ali izločimo iz prehrane. Vsako vztrajno nelagodje ali druge negativne stranske učinke je treba obvestiti zdravnika za nadaljnji zdravniški pregled.