Shakespearove sonetne teme raziskujejo ideje ljubezni, staranja, lepote, časa, poželenja, praktičnih obveznosti in občutkov nesposobnosti. Te teme izhajajo iz Shakespearovih opisov odnosov med njegovimi liki. Očitne so tudi v njegovi uporabi pripovednega jezika in razlagah govornikovih notranjih občutkov. Dodatne teme Shakespearovih sonetov vključujejo boj med tem, kar je kolektivna družba pripravljena sprejeti, in posameznikovimi željami.
Znotraj Shakespearove poezije je ideja, da lepota s časom izgine, zaradi česar je človek manj zaželen in nekoliko depresiven glede lastnega obstoja. Ideja, ki stoji za eno najbolj plodnih Shakespearovih sonetnih tem, je, da bi se morali otroci roditi, da bi ohranili lepoto. Ker je sposobnost ohranjanja idealne postave in nabora privlačnega videza nemogoča, je edino upanje ustvariti naslednjo generacijo, ki bo podedovala te lastnosti. Čas je viden kot sovražnik vitalnosti, vrednosti in fizične identitete.
Druga tema Shakespearovega soneta se osredotoča na idejo konflikta med resnično ljubeznijo in preprosto spolno željo. Po pesnikovem mnenju je pogosto zmeda, kaj je kaj. Poželenje se lahko prikrije kot ljubezen in se zlahka zamenja z njo. Obstaja skušnjava, da bi sledili tistemu, kar je vizualno mamljivo, namesto da bi si vzeli čas za odkrivanje pristnih občutkov.
Shakespeare raziskuje tudi idejo, da sta ljubezen ali čustva ljubezni lahko škodljiva. V jeziku svoje poezije avtor opisuje čustvene in fizične učinke vpetosti v romantična razmerja. Bolezen je ena od posledic, poleg negativnih občutkov osamljenosti, ki se pojavijo ob ločitvi. Obstaja tudi tveganje za ranljivost zaradi romantičnega razmerja, saj postanejo življenja, odločitve in samopodobe posameznikov odvisni drug od drugega.
Znotraj Shakespearovih sonetnih tem je uporaba simbolov. Nekatere med njimi vključujejo zvezde, drevesa, rože in vreme. Na primer, ponavljajoči se simbol vremena in letnih časov se uporablja za sporočanje burne narave za človeškim občutkom. Odnosi pogosto potekajo skozi iste vrste ciklov kot vremenski vzorci, kar Shakespeare jasno ponazori v jeziku nekaterih svojih verzov.
Simbol zvezd avtor uporablja za sporočanje ideje o usodi. Namesto da bi sprejel idejo, da je usoda vnaprej določena, Shakespeare raziskuje idejo o sposobnosti posameznika, da ustvari svojo usodo. Rože in drevesa predstavljajo občutljivo naravo življenja in lepote. Na nek način posedovanje lepote človeka obvezuje, da ima otroke in zagotavlja ugodnejše razmere za prihodnje generacije.